146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0206 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  100 
 
 		 363 aa  692    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  45.83 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  37.95 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  34.29 
 
 		 298 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  38.15 
 
 		 306 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  36.8 
 
 		 325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 298 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  33.72 
 
 		 339 aa  159  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 299 aa  159  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  37.46 
 
 		 303 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  33.14 
 
 		 298 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.14 
 
 		 336 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  33.14 
 
 		 298 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  33.14 
 
 		 298 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  33.14 
 
 		 298 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  33.14 
 
 		 298 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  33.14 
 
 		 298 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  31.52 
 
 		 294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 296 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 302 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  34.46 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  34.46 
 
 		 296 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 295 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 293 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  30.84 
 
 		 299 aa  146  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  36.23 
 
 		 307 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  29.61 
 
 		 303 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  30.81 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  32.76 
 
 		 298 aa  142  8e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  30.55 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  30.88 
 
 		 640 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.9 
 
 		 299 aa  138  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  32.58 
 
 		 294 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 309 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  30.31 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.44 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  28.33 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.44 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  28.81 
 
 		 305 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  31.21 
 
 		 327 aa  126  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  30.5 
 
 		 297 aa  126  7e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 300 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  26.05 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  28.87 
 
 		 289 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  30.65 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  28.32 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  32.31 
 
 		 308 aa  110  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  28.47 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  42.31 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  27.57 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  47.52 
 
 		 120 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  45.95 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  27.59 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.52 
 
 		 584 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  43.24 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  45.05 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  28.05 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  30.77 
 
 		 334 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  24.08 
 
 		 425 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  24.32 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  23.3 
 
 		 323 aa  49.3  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0473  inner-membrane translocator  30.3 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000422967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3398  inner-membrane translocator  26.17 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0288037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  30.48 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  23.87 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2015  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 287 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.60727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  30.48 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  26.76 
 
 		 308 aa  47  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  28.32 
 
 		 304 aa  46.6  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  27.64 
 
 		 310 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  25.76 
 
 		 335 aa  46.6  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  29.52 
 
 		 344 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>