79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2839 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  100 
 
 		 120 aa  238  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  73.39 
 
 		 307 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  61.86 
 
 		 330 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  60 
 
 		 313 aa  122  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  60.2 
 
 		 315 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  63.83 
 
 		 306 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  60.2 
 
 		 298 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  60.2 
 
 		 298 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  60.2 
 
 		 298 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  56.31 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  59.18 
 
 		 312 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  59.18 
 
 		 298 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  60.2 
 
 		 298 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  58.16 
 
 		 298 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  50.93 
 
 		 293 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  59.79 
 
 		 300 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  52.88 
 
 		 365 aa  116  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  56.86 
 
 		 299 aa  116  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  57.14 
 
 		 298 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  53.33 
 
 		 309 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  60.2 
 
 		 295 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  59.8 
 
 		 304 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  57.84 
 
 		 302 aa  114  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  55.1 
 
 		 303 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  55.88 
 
 		 296 aa  114  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  53.92 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  53.92 
 
 		 302 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  50 
 
 		 303 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  45.3 
 
 		 299 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  55.67 
 
 		 299 aa  106  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  58.16 
 
 		 336 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  58.16 
 
 		 298 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  55.67 
 
 		 299 aa  106  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  58.16 
 
 		 298 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  58.16 
 
 		 298 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  58.16 
 
 		 298 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  58.16 
 
 		 298 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  58.16 
 
 		 298 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  54.29 
 
 		 313 aa  106  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  57.43 
 
 		 330 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  50.98 
 
 		 305 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  58.42 
 
 		 329 aa  104  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  57.14 
 
 		 339 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  48.91 
 
 		 584 aa  102  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  61.22 
 
 		 295 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  61.22 
 
 		 295 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  47.79 
 
 		 297 aa  100  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  51.61 
 
 		 298 aa  99.8  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  58.76 
 
 		 294 aa  98.2  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  58.76 
 
 		 294 aa  98.6  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  53.76 
 
 		 299 aa  97.8  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  57.73 
 
 		 294 aa  97.1  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  53.33 
 
 		 311 aa  97.1  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  56.12 
 
 		 294 aa  97.1  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  58.16 
 
 		 327 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  47.52 
 
 		 363 aa  95.9  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  57.43 
 
 		 292 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  52.38 
 
 		 317 aa  94.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  51.55 
 
 		 297 aa  93.6  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  59.18 
 
 		 293 aa  93.6  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  50 
 
 		 300 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  56.7 
 
 		 294 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  52.58 
 
 		 299 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  54.46 
 
 		 292 aa  90.1  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  51 
 
 		 299 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  55.7 
 
 		 308 aa  89  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  55.45 
 
 		 292 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  54.46 
 
 		 296 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  50 
 
 		 299 aa  85.1  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  54.46 
 
 		 296 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  47.73 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  45.1 
 
 		 329 aa  81.6  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  51.02 
 
 		 640 aa  80.5  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 306 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  51.9 
 
 		 289 aa  77.4  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  37.63 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  36.56 
 
 		 305 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  41.3 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>