190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1154 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  100 
 
 
289 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  77 
 
 
287 aa  412  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  55.17 
 
 
297 aa  286  2e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  54.96 
 
 
299 aa  284  9e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  53.41 
 
 
299 aa  261  8e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  55.56 
 
 
308 aa  253  3e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  45.99 
 
 
302 aa  228  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  45.04 
 
 
306 aa  225  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  44.37 
 
 
309 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  44.18 
 
 
298 aa  221  8e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  43.94 
 
 
329 aa  215  8e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  44.52 
 
 
315 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  45.65 
 
 
305 aa  212  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  43.21 
 
 
307 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  41.44 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  45.91 
 
 
313 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  42.45 
 
 
304 aa  198  9e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  40.54 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  40.88 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  44.72 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  42.01 
 
 
298 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  42.01 
 
 
298 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  42.01 
 
 
298 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  42.01 
 
 
298 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  42.16 
 
 
298 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  42.5 
 
 
299 aa  191  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  40.67 
 
 
313 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  41.9 
 
 
298 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  42.16 
 
 
298 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  43.06 
 
 
339 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  40.14 
 
 
330 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  42.71 
 
 
336 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  42.71 
 
 
298 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  42.71 
 
 
298 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  42.71 
 
 
298 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  42.71 
 
 
298 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  42.71 
 
 
298 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  42.71 
 
 
298 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  41.2 
 
 
302 aa  178  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  40.85 
 
 
302 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  45.37 
 
 
584 aa  177  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  41.24 
 
 
330 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  42.76 
 
 
299 aa  176  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  43.01 
 
 
299 aa  175  6e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  39.52 
 
 
303 aa  175  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  42.55 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  42.02 
 
 
296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  41.32 
 
 
294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  40.56 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  39.93 
 
 
295 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40 
 
 
294 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  40.14 
 
 
295 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  37.45 
 
 
305 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  37.45 
 
 
305 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40 
 
 
294 aa  169  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  35.94 
 
 
293 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  42.2 
 
 
296 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  41.61 
 
 
299 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  40.36 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  43.55 
 
 
303 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  36.04 
 
 
365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  37.91 
 
 
311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  37.91 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  40.85 
 
 
292 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  39.45 
 
 
293 aa  161  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  41.94 
 
 
292 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 
327 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  38.89 
 
 
299 aa  160  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  42.35 
 
 
299 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  40.29 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  40.15 
 
 
640 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  35.47 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  38.6 
 
 
297 aa  139  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  42.35 
 
 
300 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  32.4 
 
 
329 aa  136  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  30.89 
 
 
363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  52.17 
 
 
120 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  32.63 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  27.6 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  28.5 
 
 
325 aa  62.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  27.91 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  28.37 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  28.83 
 
 
314 aa  59.3  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  30 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  27.44 
 
 
351 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  28.92 
 
 
311 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 
311 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 
311 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  28.92 
 
 
311 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 
311 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 
311 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 
311 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  28.43 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  28.43 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  28.92 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  27.13 
 
 
339 aa  52.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  26.63 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0052  ABC transporter, permease, sugar transport  25.71 
 
 
332 aa  51.2  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3520  inner-membrane translocator  26.24 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>