132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1713 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  100 
 
 		 299 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  86.15 
 
 		 299 aa  487  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  85.47 
 
 		 299 aa  484  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  61.07 
 
 		 298 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  61.07 
 
 		 298 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  61.07 
 
 		 298 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  60.74 
 
 		 298 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  62.08 
 
 		 298 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  60.07 
 
 		 298 aa  335  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  59.73 
 
 		 295 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  60.54 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  60.54 
 
 		 336 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  59.4 
 
 		 295 aa  329  4e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  60.54 
 
 		 298 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  60.54 
 
 		 298 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  60.54 
 
 		 298 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  60.54 
 
 		 298 aa  328  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  60.54 
 
 		 298 aa  328  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  60.54 
 
 		 298 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  58.72 
 
 		 298 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  60.74 
 
 		 296 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  60.88 
 
 		 302 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  60.74 
 
 		 296 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  59.73 
 
 		 294 aa  322  6e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  60.54 
 
 		 302 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  60.54 
 
 		 303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  62.12 
 
 		 313 aa  319  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  59.12 
 
 		 293 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  55.18 
 
 		 312 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  57.67 
 
 		 296 aa  295  8e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  54 
 
 		 300 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  55.52 
 
 		 292 aa  279  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  51.84 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  51.18 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  49.66 
 
 		 299 aa  276  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  50.51 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  53.95 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  51.2 
 
 		 294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  51.2 
 
 		 294 aa  268  8e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  51.55 
 
 		 294 aa  268  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  50.52 
 
 		 294 aa  261  6.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  52.76 
 
 		 292 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  49.5 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  49.32 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  48.23 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  47.83 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  44.34 
 
 		 325 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  50 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  46.33 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  44.08 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  45.67 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  46.44 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  42.7 
 
 		 293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  45.07 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  42.01 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  41.81 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  43.79 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  41.11 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  40.48 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  39.93 
 
 		 305 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  45.36 
 
 		 640 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  40.14 
 
 		 303 aa  195  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.2 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  37.85 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  41.82 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.89 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.11 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  44.25 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  39.05 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  39.01 
 
 		 299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.34 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.78 
 
 		 584 aa  158  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 363 aa  156  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  52.58 
 
 		 120 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  25.86 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  25.43 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  25.43 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  25.43 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  25.43 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  25.43 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  25.43 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  25.43 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  25 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  25 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  29.73 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  26.99 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1189  inner-membrane translocator  25.87 
 
 		 331 aa  49.3  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.227031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  29.09 
 
 		 372 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  24.57 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  28.51 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  24.62 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6561  Monosaccharide-transporting ATPase  27.62 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>