194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2162 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  100 
 
 
295 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  72.11 
 
 
315 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  55.56 
 
 
300 aa  281  9e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  52.53 
 
 
298 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  52.53 
 
 
298 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  53.58 
 
 
295 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  52.53 
 
 
298 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  52.53 
 
 
298 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  53.58 
 
 
295 aa  276  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  54.95 
 
 
293 aa  275  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  53.54 
 
 
298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  50.67 
 
 
298 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  53.72 
 
 
312 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  52.68 
 
 
339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  51.69 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  51.18 
 
 
298 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  49.16 
 
 
299 aa  263  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  51.85 
 
 
336 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  51.85 
 
 
298 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  51.85 
 
 
298 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  51.85 
 
 
298 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  51.85 
 
 
298 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  51.85 
 
 
298 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  51.85 
 
 
298 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  50.85 
 
 
302 aa  262  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  52.56 
 
 
311 aa  261  8e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  50.51 
 
 
302 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  51.19 
 
 
303 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  53.92 
 
 
296 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  53.92 
 
 
296 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  52.23 
 
 
292 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  51.88 
 
 
294 aa  255  5e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  51.19 
 
 
317 aa  255  6e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  51.55 
 
 
294 aa  254  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  53.45 
 
 
292 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  52.94 
 
 
294 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  51.19 
 
 
294 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  52.94 
 
 
292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  51.54 
 
 
313 aa  252  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  53.45 
 
 
307 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  50.17 
 
 
299 aa  250  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  49.47 
 
 
306 aa  249  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  49.83 
 
 
299 aa  248  6e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  54.14 
 
 
296 aa  248  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  49.65 
 
 
309 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  51.86 
 
 
327 aa  246  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  49.5 
 
 
299 aa  246  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  49.52 
 
 
325 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  48.18 
 
 
330 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  51.06 
 
 
329 aa  235  6e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  51.19 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  44.79 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  47.96 
 
 
304 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  49.08 
 
 
308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  48.88 
 
 
299 aa  232  7.000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  48.49 
 
 
297 aa  231  8.000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  48 
 
 
330 aa  225  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  45.21 
 
 
305 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.06 
 
 
297 aa  224  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  43.05 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  42.05 
 
 
313 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  40.36 
 
 
305 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  40.71 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  42.76 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  45.99 
 
 
640 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  37.98 
 
 
298 aa  192  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  43.77 
 
 
303 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  40.22 
 
 
287 aa  178  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  41.18 
 
 
299 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.16 
 
 
289 aa  177  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  35.57 
 
 
365 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  37.68 
 
 
289 aa  168  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.86 
 
 
584 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  43.7 
 
 
300 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  36.2 
 
 
329 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  32.85 
 
 
363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  60.2 
 
 
120 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  33.1 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  28.02 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  28.02 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  27.54 
 
 
311 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  27.54 
 
 
311 aa  62.4  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6098  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  26.52 
 
 
330 aa  62.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  27.54 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  27.54 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  29.9 
 
 
341 aa  59.3  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  26.46 
 
 
322 aa  56.2  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  27.27 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  24.49 
 
 
348 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  27.56 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  30.86 
 
 
348 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  26.69 
 
 
328 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0077  inner-membrane translocator  26.69 
 
 
331 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  23.76 
 
 
314 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>