More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1896 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  100 
 
 		 285 aa  570  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  81.34 
 
 		 285 aa  472  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  61.87 
 
 		 285 aa  358  8e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  52 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  47.65 
 
 		 288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  42.76 
 
 		 287 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  43.11 
 
 		 287 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  39.57 
 
 		 280 aa  192  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.99 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  41.34 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  41.64 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  41.84 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.41 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  41.34 
 
 		 281 aa  178  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 281 aa  175  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  36.88 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  42.39 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  38.77 
 
 		 284 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  38.04 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  38.25 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  36.2 
 
 		 291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  36.2 
 
 		 291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  36.2 
 
 		 291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  36.2 
 
 		 291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  36.2 
 
 		 291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  38.73 
 
 		 290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  36.2 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  35.13 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  32.89 
 
 		 325 aa  159  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  40.29 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  34.64 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 279 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  41.13 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  35.44 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 283 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  38.86 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  33.92 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  31.23 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  35.83 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.08 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  39.16 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  33 
 
 		 287 aa  96.3  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.55 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 415 aa  92.8  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  35.39 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  31.32 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  22.79 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  25.99 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.9 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  35.12 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  28.41 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  29.94 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  34.52 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.41 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  35.43 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  34.23 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  29.52 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.17 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.53 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.19 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.45 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  25.84 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.22 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.64 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000587821  hitchhiker  0.0091617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.05 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.16 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.72 
 
 		 251 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1338  Methyltransferase type 11  41.28 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00439312  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.26 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  35.17 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  26.64 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.27 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>