More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0217 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0217  virulence factor MVIN-like  100 
 
 
533 aa  1012    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0011  integral membrane protein MviN  80 
 
 
529 aa  690    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295348  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0250  integral membrane protein MviN  62.95 
 
 
518 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0714023  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0037  putative virulence factor MviN-like protein  58.69 
 
 
518 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236522  normal  0.272739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0460  integral membrane protein MviN  59.38 
 
 
518 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0458  integral membrane protein MviN  66.74 
 
 
537 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0582  integral membrane protein MviN  62.35 
 
 
518 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0591354  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  39.81 
 
 
512 aa  304  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  41.32 
 
 
543 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  38.06 
 
 
513 aa  269  7e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  39.13 
 
 
514 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  37.43 
 
 
513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  37.67 
 
 
513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  39.19 
 
 
528 aa  264  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  35.39 
 
 
520 aa  249  9e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  38.03 
 
 
522 aa  249  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  36.44 
 
 
529 aa  248  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  38.54 
 
 
513 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  35.4 
 
 
529 aa  243  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  40.14 
 
 
509 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  39.86 
 
 
509 aa  240  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  35.7 
 
 
521 aa  238  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  36.17 
 
 
555 aa  238  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  36.93 
 
 
535 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  35.44 
 
 
514 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  37.67 
 
 
522 aa  230  6e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  36.18 
 
 
525 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  39.01 
 
 
508 aa  227  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  37.99 
 
 
532 aa  227  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  35.71 
 
 
508 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  35.76 
 
 
509 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  35.69 
 
 
509 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  34.73 
 
 
526 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  37.73 
 
 
534 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  34.53 
 
 
528 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3497  integral membrane protein MviN  40.09 
 
 
509 aa  220  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319117  normal  0.680185 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  29.06 
 
 
495 aa  219  7.999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 
518 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  35.49 
 
 
509 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  40.19 
 
 
510 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  35.59 
 
 
534 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  31.53 
 
 
508 aa  211  4e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  38.5 
 
 
530 aa  210  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  35.46 
 
 
515 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  31.16 
 
 
519 aa  207  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  36.07 
 
 
513 aa  206  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  31.51 
 
 
524 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  31.51 
 
 
524 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  31.51 
 
 
524 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  31.51 
 
 
524 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  31.51 
 
 
524 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  38.06 
 
 
508 aa  206  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.342174 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  29.85 
 
 
501 aa  206  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  32.81 
 
 
529 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  31.12 
 
 
511 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  34.53 
 
 
512 aa  205  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  32.41 
 
 
530 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  36.16 
 
 
509 aa  204  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  31.51 
 
 
512 aa  203  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  32.25 
 
 
519 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  32.87 
 
 
517 aa  202  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  32.48 
 
 
523 aa  202  9e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  34.02 
 
 
517 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  30.95 
 
 
519 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  36.32 
 
 
511 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  34.02 
 
 
517 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  31.85 
 
 
511 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  32.81 
 
 
516 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  31.64 
 
 
530 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  35.28 
 
 
509 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  34.87 
 
 
525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  39.24 
 
 
509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  34.46 
 
 
515 aa  201  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  32.05 
 
 
519 aa  200  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  31.23 
 
 
525 aa  200  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  32.01 
 
 
523 aa  199  9e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  33.73 
 
 
512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5302  integral membrane protein MviN  39.81 
 
 
509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  32.17 
 
 
511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  33.73 
 
 
512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  32.48 
 
 
512 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  32.35 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  35.13 
 
 
511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 
515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  33.03 
 
 
519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  32.83 
 
 
513 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  32.81 
 
 
519 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  32.81 
 
 
519 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  32.81 
 
 
519 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  30.41 
 
 
519 aa  196  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  32.81 
 
 
522 aa  196  9e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  31.38 
 
 
511 aa  196  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  31.97 
 
 
511 aa  196  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  34.86 
 
 
523 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  30.58 
 
 
528 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  32.4 
 
 
512 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  30.25 
 
 
518 aa  195  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  30.3 
 
 
521 aa  195  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  30.71 
 
 
512 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  33.4 
 
 
495 aa  194  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>