More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0458 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0458  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 537 aa  990    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0250  integral membrane protein MviN  68.28 
 
 		 518 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0714023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0460  integral membrane protein MviN  66.02 
 
 		 518 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0037  putative virulence factor MviN-like protein  63.23 
 
 		 518 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236522  normal  0.272739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0011  integral membrane protein MviN  64.47 
 
 		 529 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295348  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0582  integral membrane protein MviN  68.09 
 
 		 518 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0591354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0217  virulence factor MVIN-like  61.72 
 
 		 533 aa  504  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  34.62 
 
 		 529 aa  261  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  35 
 
 		 529 aa  259  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  34.52 
 
 		 555 aa  253  8.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  37.52 
 
 		 543 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  36.84 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  36.33 
 
 		 535 aa  249  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  35.38 
 
 		 520 aa  245  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  36.43 
 
 		 513 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  35.92 
 
 		 509 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  36.24 
 
 		 513 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  36.24 
 
 		 513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  36.29 
 
 		 514 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  34.29 
 
 		 526 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 528 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  39.19 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  36.84 
 
 		 528 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  35.95 
 
 		 514 aa  230  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  39.19 
 
 		 509 aa  230  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  34.87 
 
 		 509 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  36.1 
 
 		 522 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  37.18 
 
 		 508 aa  225  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  37.17 
 
 		 534 aa  224  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  29.88 
 
 		 495 aa  223  7e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  34.31 
 
 		 509 aa  223  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  38.77 
 
 		 508 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  37.47 
 
 		 525 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  37.96 
 
 		 522 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  36.55 
 
 		 529 aa  216  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  38.7 
 
 		 508 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.342174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3497  integral membrane protein MviN  39.34 
 
 		 509 aa  213  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319117  normal  0.680185 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  32.48 
 
 		 511 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  34.17 
 
 		 509 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  33.79 
 
 		 512 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  32.61 
 
 		 511 aa  210  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  33.79 
 
 		 512 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  34.59 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  33.46 
 
 		 534 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  34.93 
 
 		 521 aa  208  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  36.1 
 
 		 532 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  36.79 
 
 		 512 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  39.37 
 
 		 509 aa  207  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  36.08 
 
 		 530 aa  207  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  36.08 
 
 		 524 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  36.08 
 
 		 524 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  36.08 
 
 		 524 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  36.08 
 
 		 524 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  36.08 
 
 		 524 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  32.68 
 
 		 512 aa  206  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  36.62 
 
 		 513 aa  206  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  32.47 
 
 		 512 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  32.2 
 
 		 511 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  32.67 
 
 		 528 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  32.09 
 
 		 511 aa  204  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  36.43 
 
 		 511 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  36.53 
 
 		 512 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  33.8 
 
 		 512 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  32.09 
 
 		 542 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  35.99 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2251  membrane protein MviN  37.76 
 
 		 513 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0136199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  35.99 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  35.99 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  33.72 
 
 		 523 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  35.99 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  35.99 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  35.99 
 
 		 511 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  35.99 
 
 		 511 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  33.46 
 
 		 513 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  35.99 
 
 		 511 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  35.99 
 
 		 511 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  31.77 
 
 		 511 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  35.23 
 
 		 517 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  35.23 
 
 		 517 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  35.99 
 
 		 511 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  36.96 
 
 		 515 aa  200  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  31.67 
 
 		 511 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  34.27 
 
 		 517 aa  199  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0011  integral membrane protein MviN  35.84 
 
 		 518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0453851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  30.8 
 
 		 508 aa  195  1e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  37.37 
 
 		 521 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  33.13 
 
 		 513 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  32.87 
 
 		 530 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  41.5 
 
 		 510 aa  193  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  34.5 
 
 		 518 aa  193  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  35.62 
 
 		 515 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  35.09 
 
 		 528 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  32.55 
 
 		 530 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  32.59 
 
 		 522 aa  192  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5302  integral membrane protein MviN  39.39 
 
 		 509 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  37.38 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  35.06 
 
 		 509 aa  189  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  34.13 
 
 		 514 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  34.35 
 
 		 495 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  35.37 
 
 		 515 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>