More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0250 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0460  integral membrane protein MviN  82.01 
 
 		 518 aa  719    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0582  integral membrane protein MviN  89.38 
 
 		 518 aa  726    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0591354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0250  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 518 aa  956    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0714023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0458  integral membrane protein MviN  68.28 
 
 		 537 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0037  putative virulence factor MviN-like protein  63.84 
 
 		 518 aa  507  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236522  normal  0.272739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0011  integral membrane protein MviN  63.27 
 
 		 529 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295348  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0217  virulence factor MVIN-like  62.08 
 
 		 533 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  38.33 
 
 		 512 aa  266  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  34.69 
 
 		 529 aa  255  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  39.15 
 
 		 528 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  34.98 
 
 		 520 aa  251  3e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  34.69 
 
 		 555 aa  244  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  35.66 
 
 		 528 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  38.51 
 
 		 543 aa  239  8e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  35.27 
 
 		 526 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  36.59 
 
 		 514 aa  236  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  33.85 
 
 		 529 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  37.14 
 
 		 513 aa  230  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  37.14 
 
 		 513 aa  230  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  36.78 
 
 		 535 aa  229  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  37.07 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  36.83 
 
 		 514 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  36.84 
 
 		 509 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  35.35 
 
 		 513 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  37.31 
 
 		 534 aa  220  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  33.53 
 
 		 509 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  34.83 
 
 		 509 aa  219  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  35.98 
 
 		 532 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  36.02 
 
 		 508 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 521 aa  213  7e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3497  integral membrane protein MviN  37.76 
 
 		 509 aa  213  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319117  normal  0.680185 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  35.65 
 
 		 522 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  28.37 
 
 		 495 aa  209  1e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  37.38 
 
 		 513 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  33.4 
 
 		 534 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  33.8 
 
 		 508 aa  204  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  33.73 
 
 		 509 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  33.4 
 
 		 509 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  34.96 
 
 		 530 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  33.98 
 
 		 522 aa  200  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  38.41 
 
 		 510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  33.49 
 
 		 515 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  36.06 
 
 		 515 aa  196  7e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  31.78 
 
 		 518 aa  196  8.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  33.49 
 
 		 515 aa  196  9e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  34.63 
 
 		 525 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  30.31 
 
 		 512 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  32.06 
 
 		 534 aa  193  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  33.48 
 
 		 517 aa  193  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  33.56 
 
 		 519 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  32.18 
 
 		 522 aa  193  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 519 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 519 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 519 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  31.74 
 
 		 528 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2251  membrane protein MviN  34.05 
 
 		 513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0136199  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  31.96 
 
 		 519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  32.47 
 
 		 528 aa  191  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  31.96 
 
 		 519 aa  191  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  31.05 
 
 		 523 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  31.05 
 
 		 523 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  32.66 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  35.92 
 
 		 509 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  31.97 
 
 		 530 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  30.48 
 
 		 512 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  32.15 
 
 		 512 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  32.23 
 
 		 520 aa  187  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  31.83 
 
 		 519 aa  187  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  32.15 
 
 		 512 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  33.1 
 
 		 511 aa  187  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  33.8 
 
 		 529 aa  186  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  32.19 
 
 		 517 aa  186  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  32.19 
 
 		 517 aa  186  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  31.07 
 
 		 508 aa  186  8e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  30.7 
 
 		 511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  35.83 
 
 		 508 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.342174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  32.02 
 
 		 512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  32.84 
 
 		 518 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  31.69 
 
 		 511 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  34.27 
 
 		 509 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  31.89 
 
 		 519 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 519 aa  183  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  29.38 
 
 		 516 aa  183  8.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  30.08 
 
 		 511 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  29.23 
 
 		 501 aa  182  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  32.02 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0543  integral membrane protein MviN  38.06 
 
 		 527 aa  182  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  33.27 
 
 		 523 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  31.48 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  33.83 
 
 		 513 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  29.49 
 
 		 524 aa  182  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  30 
 
 		 519 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0011  integral membrane protein MviN  35.01 
 
 		 518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0453851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  32.14 
 
 		 522 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  32.94 
 
 		 513 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  32.02 
 
 		 511 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 		 512 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  30.82 
 
 		 523 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  31.52 
 
 		 519 aa  179  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  32.02 
 
 		 542 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>