More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0158 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  100 
 
 
456 aa  934  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  51.65 
 
 
450 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.97198e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  49.65 
 
 
460 aa  440  1e-122  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85269e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 
458 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 
458 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  48.83 
 
 
458 aa  435  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 
458 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 
458 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 
458 aa  435  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 
458 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 
458 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  48.83 
 
 
458 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  48.6 
 
 
458 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  48.57 
 
 
448 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  48.02 
 
 
452 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  50 
 
 
449 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  45.39 
 
 
457 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  48.36 
 
 
458 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  49.55 
 
 
449 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  46.83 
 
 
454 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  46.94 
 
 
457 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  48.48 
 
 
457 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  48.72 
 
 
454 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  48.72 
 
 
454 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  47.45 
 
 
453 aa  425  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.66532e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  48.83 
 
 
450 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  47.28 
 
 
484 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  47.4 
 
 
453 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  46.78 
 
 
452 aa  416  1e-115  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  47.6 
 
 
462 aa  417  1e-115  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  49.3 
 
 
457 aa  417  1e-115  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  46.14 
 
 
448 aa  417  1e-115  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3565  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 
471 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  0.041039 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  48.36 
 
 
470 aa  412  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0626  DNA repair protein RadA  46.39 
 
 
459 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  45.02 
 
 
457 aa  413  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  46.24 
 
 
453 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  45.95 
 
 
451 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.21912e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  45.63 
 
 
459 aa  414  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02144e-10 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  43.96 
 
 
455 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  48.25 
 
 
446 aa  411  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  47.1 
 
 
489 aa  411  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1188  DNA repair protein RadA  46.7 
 
 
458 aa  409  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  47.9 
 
 
462 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  48.6 
 
 
453 aa  410  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  45.51 
 
 
452 aa  406  1e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03370  DNA repair protein RadA  46.51 
 
 
459 aa  408  1e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  45.85 
 
 
459 aa  407  1e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  46.21 
 
 
445 aa  408  1e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  46.05 
 
 
462 aa  407  1e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  44.71 
 
 
457 aa  408  1e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  45.63 
 
 
447 aa  405  1e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  46.44 
 
 
453 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  45.27 
 
 
453 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  45.49 
 
 
455 aa  402  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  44.54 
 
 
467 aa  405  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  45.39 
 
 
462 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  44.25 
 
 
462 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2456  DNA repair protein RadA  47.95 
 
 
452 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1119  DNA repair protein RadA  47.95 
 
 
452 aa  401  1e-110  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  45.05 
 
 
453 aa  399  1e-110  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  43.9 
 
 
466 aa  399  1e-110  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  43.86 
 
 
465 aa  401  1e-110  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  44.62 
 
 
455 aa  399  1e-110  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1110  DNA repair protein RadA  44.4 
 
 
454 aa  399  1e-110  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  43.64 
 
 
457 aa  399  1e-110  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1045  DNA repair protein RadA  44.4 
 
 
454 aa  399  1e-110  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.665867  normal  0.0445974 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  44.05 
 
 
451 aa  399  1e-110  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1064  DNA repair protein RadA  47.27 
 
 
452 aa  400  1e-110  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  47.24 
 
 
456 aa  399  1e-110  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3538  DNA repair protein RadA  47.9 
 
 
462 aa  398  1e-110  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  47.24 
 
 
456 aa  399  1e-110  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1049  DNA repair protein RadA  44.4 
 
 
454 aa  399  1e-110  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0406  DNA repair protein RadA  46.27 
 
 
454 aa  401  1e-110  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.509389  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  46.55 
 
 
443 aa  399  1e-110  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3219  DNA repair protein RadA  44.4 
 
 
454 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1226  DNA repair protein RadA  44.4 
 
 
454 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  43.81 
 
 
507 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  46.19 
 
 
449 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1280  DNA repair protein RadA  44.98 
 
 
454 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2814  DNA repair protein RadA  44.4 
 
 
454 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1148  DNA repair protein RadA  44.4 
 
 
454 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0825  DNA repair protein RadA  44.89 
 
 
460 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3621  DNA repair protein RadA  44.89 
 
 
460 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  47.67 
 
 
454 aa  397  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1712  DNA repair protein RadA  45.45 
 
 
455 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.136365  normal  0.743682 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3358  DNA repair protein RadA  44.4 
 
 
454 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.918494 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  43.36 
 
 
448 aa  397  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3492  DNA repair protein RadA  44.89 
 
 
460 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  45.45 
 
 
450 aa  397  1e-109  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  44.96 
 
 
457 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3219  DNA repair protein RadA  44.4 
 
 
454 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04230  hypothetical protein  44 
 
 
460 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  43.52 
 
 
456 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3667  DNA repair protein RadA  44 
 
 
460 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.696085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4938  DNA repair protein RadA  44 
 
 
460 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.664332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  44 
 
 
460 aa  393  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  43.96 
 
 
448 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  43.76 
 
 
453 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  45.2 
 
 
461 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>