More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1937 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 311 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  50.92 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  49.83 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  45.54 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  51.08 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  49.83 
 
 		 311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  46.13 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  44.24 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  42.9 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  44.34 
 
 		 312 aa  222  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  47.27 
 
 		 312 aa  219  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  45.23 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  45.77 
 
 		 311 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11830  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  40.68 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  46.1 
 
 		 288 aa  202  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  35.9 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  44.91 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  35.65 
 
 		 317 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  34.05 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0522  periplasmic solute binding protein  36.74 
 
 		 349 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0088  periplasmic solute binding protein  44.87 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2168  periplasmic solute binding protein  43.34 
 
 		 333 aa  179  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0250158  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  35.65 
 
 		 349 aa  175  9e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  31.68 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  36.28 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  34.04 
 
 		 332 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  32.69 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  35.97 
 
 		 347 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  33.65 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  29.47 
 
 		 317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  29.47 
 
 		 317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  35.67 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  33.12 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  33.33 
 
 		 506 aa  147  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  48.8 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  28.83 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  29.63 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  30.55 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  30.03 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  29.63 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  29.63 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  29.63 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  29.63 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  28.3 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  28.4 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  29.35 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  30.51 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  28.4 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  29.31 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.42 
 
 		 514 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  28.23 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  30.7 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  29.69 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  30.18 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  31.75 
 
 		 304 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 		 306 aa  126  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  32.8 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  34.04 
 
 		 333 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  26.01 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  26.06 
 
 		 331 aa  122  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  31.95 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  33.69 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 		 316 aa  119  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  38.52 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  28.14 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  33.6 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  27.31 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.49 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  28.62 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  31.3 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  24.85 
 
 		 515 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  27.03 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  24.85 
 
 		 515 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  27.62 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  29.07 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  26.62 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  28.96 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  34.71 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  28.03 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  26.48 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0963  periplasmic solute binding protein  28.36 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.000541493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  34 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  31.72 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  30.89 
 
 		 294 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  32.16 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  32.22 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  29.77 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  26.92 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  27.04 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  23.08 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  29.76 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  32.78 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  30.43 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 335 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  31.93 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>