61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_3048 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  37.25 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3012  hypothetical protein  38.03 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.51732  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01123  hypothetical protein  25 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  30.41 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  31.08 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  29.45 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  32.43 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2847  hypothetical protein  25.9 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  27.97 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  29.66 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2292  hypothetical protein  30.2 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0324  transmembrane protein  30.5 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0115837 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1625  hypothetical protein  28.08 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  29.71 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  29.71 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  29.5 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  29.5 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  29.5 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  29.5 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  29.5 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  29.5 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  29.5 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  25.9 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  29.66 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  29.71 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  29.71 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  29.71 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  29.71 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  30.14 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  28.48 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  30.34 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  31.29 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1244  putative transmembrane protein  30.82 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  30.22 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  31.88 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  29.08 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  28.67 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4393  putative transmembrane protein  29.93 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427837  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  28.17 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  27.66 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  30.87 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  30.71 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  26.32 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  27.08 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  28.77 
 
 		 171 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  26.76 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3182  putative integral membrane protein  28.47 
 
 		 190 aa  47.4  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  27.15 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  26.72 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  27.34 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  27.34 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  26.57 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  26.95 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3596  putative transmembrane protein  27.27 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  27.66 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04018  hypothetical protein  26.71 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1876  hypothetical protein  31.37 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  31.37 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  27.74 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0260  hypothetical protein  33.11 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>