More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0350 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 
406 aa  852    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  38.9 
 
 
488 aa  301  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  36.82 
 
 
448 aa  295  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  38.03 
 
 
439 aa  285  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  37.12 
 
 
448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  35.91 
 
 
441 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 
435 aa  266  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.5 
 
 
390 aa  265  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  36.09 
 
 
436 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  32.53 
 
 
435 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  34.66 
 
 
413 aa  248  9e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
402 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  35.29 
 
 
424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 
401 aa  242  7e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  33.57 
 
 
424 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  33.01 
 
 
402 aa  235  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  34.15 
 
 
431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  33.07 
 
 
404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  32.02 
 
 
401 aa  232  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  34.72 
 
 
400 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  34.04 
 
 
406 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  33.83 
 
 
386 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  35.39 
 
 
403 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  34.22 
 
 
404 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  33.7 
 
 
409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
404 aa  222  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  32.84 
 
 
402 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  34.89 
 
 
411 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  34.22 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  35.37 
 
 
414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 
412 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 
393 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  30.52 
 
 
395 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  31.39 
 
 
419 aa  216  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 
403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  33.06 
 
 
410 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  31.17 
 
 
419 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  30.66 
 
 
400 aa  209  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 
410 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
350 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  30.79 
 
 
395 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 
388 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  32.23 
 
 
399 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  31.47 
 
 
413 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  31.65 
 
 
398 aa  202  9e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  30.48 
 
 
394 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  30.75 
 
 
411 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  32.21 
 
 
396 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  30.75 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  28.86 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  31.17 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  30.02 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  30.54 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  30.87 
 
 
446 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  29.78 
 
 
396 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  29.78 
 
 
396 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  30.23 
 
 
392 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  31.74 
 
 
396 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 
396 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 
394 aa  193  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 
392 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  38.29 
 
 
364 aa  190  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  31.8 
 
 
405 aa  189  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 
395 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  39.19 
 
 
373 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  32.48 
 
 
372 aa  186  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  30.49 
 
 
403 aa  186  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  32.38 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0622  alkaline phosphatase  29.15 
 
 
439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.898935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  38.04 
 
 
370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  37.19 
 
 
364 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 
417 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  29.04 
 
 
377 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 
400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  29.83 
 
 
401 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  31.51 
 
 
389 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  29.69 
 
 
395 aa  175  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  32.95 
 
 
390 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  38.02 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  33.9 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  31.32 
 
 
405 aa  173  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  36.36 
 
 
443 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  39.53 
 
 
350 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
389 aa  170  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  36.15 
 
 
373 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  27.55 
 
 
416 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  39.45 
 
 
366 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  37.45 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 
391 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  28.53 
 
 
418 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3572  metal dependent phosphohydrolase  29.97 
 
 
516 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  31.27 
 
 
353 aa  163  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
356 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3058  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 
352 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  27 
 
 
421 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 
457 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3275  metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 
448 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.003044  normal  0.177194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 
421 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0331163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>