More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1422 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  100 
 
 
359 aa  722    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  66.56 
 
 
336 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  60.91 
 
 
339 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  53.1 
 
 
349 aa  344  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  56.62 
 
 
344 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  53.75 
 
 
354 aa  302  5.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  48.06 
 
 
348 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  45.56 
 
 
345 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  45.56 
 
 
345 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  47.7 
 
 
340 aa  251  1e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  48.37 
 
 
344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  42.98 
 
 
339 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  47.55 
 
 
350 aa  236  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  41.87 
 
 
328 aa  236  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  41.87 
 
 
328 aa  236  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  46.78 
 
 
357 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  44.66 
 
 
332 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  41.1 
 
 
328 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  43.08 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  46.43 
 
 
377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  41.77 
 
 
342 aa  212  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  44.22 
 
 
337 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  44.41 
 
 
347 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  42.07 
 
 
331 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  42.07 
 
 
331 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  42.07 
 
 
331 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  42.07 
 
 
331 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  42.07 
 
 
331 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  41.95 
 
 
331 aa  203  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  41.95 
 
 
331 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  41.95 
 
 
331 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  41.95 
 
 
331 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  41.95 
 
 
331 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  41.95 
 
 
331 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  39.88 
 
 
331 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  41.95 
 
 
332 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  41.95 
 
 
332 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  42.49 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  41.34 
 
 
331 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  41.53 
 
 
344 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  40.06 
 
 
334 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  41.31 
 
 
342 aa  193  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  41.16 
 
 
334 aa  192  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  41.95 
 
 
334 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  39.2 
 
 
335 aa  189  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  40.67 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  35.33 
 
 
281 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  35.63 
 
 
281 aa  183  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  38.98 
 
 
329 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  33.24 
 
 
335 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  42.39 
 
 
346 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  36.66 
 
 
335 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  39.76 
 
 
345 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  33.64 
 
 
329 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  33.73 
 
 
327 aa  159  7e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  35.84 
 
 
328 aa  159  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  32.91 
 
 
326 aa  153  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 
333 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  34.6 
 
 
333 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 
500 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  34.84 
 
 
330 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  32.84 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  34.22 
 
 
355 aa  129  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  31.64 
 
 
337 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  30.14 
 
 
368 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  31.14 
 
 
352 aa  122  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  29.67 
 
 
302 aa  120  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  33.44 
 
 
477 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.46 
 
 
505 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  28.86 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  27.22 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  28.8 
 
 
358 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.15 
 
 
504 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  34.46 
 
 
541 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  28.27 
 
 
395 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  28.88 
 
 
328 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  24.63 
 
 
425 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  28.39 
 
 
310 aa  103  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  30.58 
 
 
315 aa  103  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  27.35 
 
 
517 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1110  putative ABC transport system, lipoprotein  28.76 
 
 
304 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  28.05 
 
 
357 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  28.67 
 
 
314 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  35.96 
 
 
541 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  28.22 
 
 
357 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  24.59 
 
 
467 aa  99.8  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  26.05 
 
 
357 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  27.47 
 
 
354 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  27.25 
 
 
321 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  26.67 
 
 
334 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  25.36 
 
 
351 aa  98.6  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  27.63 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  27 
 
 
355 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  26.65 
 
 
355 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  28.34 
 
 
371 aa  97.1  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0123  hypothetical protein  27.63 
 
 
310 aa  97.1  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  26.94 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  26.49 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  29.5 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>