More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0460 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 353 aa  728    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  57.97 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  54.91 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  55.35 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  55.05 
 
 		 342 aa  362  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  51.77 
 
 		 381 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  51.3 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  50.97 
 
 		 372 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  51.76 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  51.76 
 
 		 354 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  51.13 
 
 		 352 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  51.13 
 
 		 352 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  52.56 
 
 		 353 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  51.45 
 
 		 370 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  46.03 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  42.44 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  40.45 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  47.08 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  39.87 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  38.66 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  38.72 
 
 		 334 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  48.23 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  38.75 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  38.98 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  38.41 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  43.31 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  42.68 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  37.94 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  36.19 
 
 		 336 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  41.43 
 
 		 324 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  37.34 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  36.54 
 
 		 352 aa  186  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  37.67 
 
 		 324 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  37.79 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  36.31 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  42.79 
 
 		 324 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  34.17 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  39.53 
 
 		 345 aa  169  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  32.18 
 
 		 425 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  36.86 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  32.04 
 
 		 351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  31.02 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  29.56 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  29.78 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  29.47 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  29.87 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  29.87 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  29.87 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  29.87 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  29.87 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  29.87 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  29.87 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  29.56 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  33.94 
 
 		 435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  29.46 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  27.11 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  28.06 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  31.82 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  36.41 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 314 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  29.52 
 
 		 382 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  28.31 
 
 		 405 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  27.34 
 
 		 528 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  26.92 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  36.45 
 
 		 235 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  26.32 
 
 		 524 aa  106  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  27.32 
 
 		 384 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  28.78 
 
 		 513 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  23.84 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 232 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  30.34 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  28.04 
 
 		 513 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  32.38 
 
 		 234 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  30.84 
 
 		 313 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  38.1 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  27.41 
 
 		 512 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  28.04 
 
 		 524 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  29.91 
 
 		 302 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 		 350 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  28.41 
 
 		 513 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  25.56 
 
 		 351 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  30.52 
 
 		 342 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  28.04 
 
 		 513 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  28.4 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  28.53 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  32.42 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  29.32 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  26.62 
 
 		 520 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  33.15 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  24.92 
 
 		 511 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  36.81 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  30.03 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  29.13 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  28.06 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  31.14 
 
 		 279 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  27.34 
 
 		 521 aa  99.8  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>