28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NmulC_2786 on replicon NC_007616
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  100 
 
 
504 aa  1045    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  65.1 
 
 
488 aa  676    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  63.67 
 
 
497 aa  632  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3090  site-specific DNA-methyltransferase  57.55 
 
 
527 aa  591  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  45.08 
 
 
495 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4247  hypothetical protein  42.83 
 
 
509 aa  376  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102223  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0104  Eco57I restriction endonuclease  39.28 
 
 
499 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  27.98 
 
 
573 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  25.82 
 
 
604 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  24.85 
 
 
595 aa  103  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  28.23 
 
 
578 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  28.23 
 
 
578 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  21.97 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  23.05 
 
 
523 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  25.98 
 
 
539 aa  70.1  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  25.33 
 
 
466 aa  67.8  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  25.07 
 
 
584 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  22.08 
 
 
533 aa  62.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  22.04 
 
 
563 aa  60.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  25.68 
 
 
522 aa  60.5  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  27.66 
 
 
534 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  24.71 
 
 
527 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  26.29 
 
 
489 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  23.64 
 
 
521 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf681  methyltransferase, HsdM related  25.79 
 
 
517 aa  48.5  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000145801  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  27.46 
 
 
243 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0062  hypothetical protein  26.42 
 
 
422 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1379  modification methylase NspV  29.03 
 
 
534 aa  43.5  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>