137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf681 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf681  methyltransferase, HsdM related  100 
 
 		 517 aa  1048    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000145801  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  33.1 
 
 		 799 aa  57.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  23.4 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  28.03 
 
 		 504 aa  57  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  22.54 
 
 		 495 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  26.62 
 
 		 499 aa  54.7  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  29.28 
 
 		 495 aa  54.3  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  27.33 
 
 		 496 aa  54.3  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  28.48 
 
 		 498 aa  53.9  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  25.97 
 
 		 499 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  26.07 
 
 		 488 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  25.4 
 
 		 523 aa  53.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  25.49 
 
 		 489 aa  53.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  24.36 
 
 		 537 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  28.21 
 
 		 505 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  27.81 
 
 		 498 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  28.57 
 
 		 501 aa  52.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  28.48 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  25.71 
 
 		 824 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.33 
 
 		 703 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  24.87 
 
 		 508 aa  51.6  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  21.12 
 
 		 490 aa  51.6  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  28.76 
 
 		 633 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  26.04 
 
 		 799 aa  51.2  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  27.08 
 
 		 814 aa  50.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  26.67 
 
 		 908 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  26.99 
 
 		 515 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  25.16 
 
 		 809 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  27.37 
 
 		 494 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  26.09 
 
 		 506 aa  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4393  type I restriction-modification system, M subunit  25.94 
 
 		 515 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  26.56 
 
 		 526 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  26.8 
 
 		 810 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  23.95 
 
 		 763 aa  50.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  23.08 
 
 		 540 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  25.73 
 
 		 508 aa  49.3  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  27.04 
 
 		 810 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  30.69 
 
 		 808 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  23.95 
 
 		 793 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  25.42 
 
 		 503 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  25.91 
 
 		 568 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  24.36 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  25.79 
 
 		 504 aa  48.5  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.17 
 
 		 508 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  26.62 
 
 		 710 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  22.51 
 
 		 493 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  27.94 
 
 		 516 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  22.44 
 
 		 535 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 499 aa  48.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24 
 
 		 663 aa  48.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2421  type I restriction-modification system, M subunit  25.52 
 
 		 526 aa  48.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1127  N-6 DNA methylase  25.7 
 
 		 302 aa  48.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1201  N-6 DNA methylase  23.85 
 
 		 499 aa  47.8  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721125  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  27.34 
 
 		 527 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  23.77 
 
 		 517 aa  47.8  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  24.86 
 
 		 569 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  29.08 
 
 		 815 aa  47.8  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  23.11 
 
 		 493 aa  47.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  19.83 
 
 		 492 aa  47.4  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  26.97 
 
 		 505 aa  47.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  22.29 
 
 		 547 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  22.35 
 
 		 710 aa  47  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  24.67 
 
 		 709 aa  47  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  23.23 
 
 		 535 aa  47  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  24.68 
 
 		 486 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  22.73 
 
 		 500 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  26.92 
 
 		 814 aa  47  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  23.32 
 
 		 497 aa  47  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  25.17 
 
 		 673 aa  47  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  24.62 
 
 		 537 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  24.68 
 
 		 525 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3269  type I restriction-modification system specificity subunit  28.17 
 
 		 498 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.266741  normal  0.0966647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  22.58 
 
 		 534 aa  47  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  27.36 
 
 		 874 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0129  type I restriction-modification system, M subunit  22.87 
 
 		 537 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  26.42 
 
 		 530 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  23.18 
 
 		 518 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  23.18 
 
 		 518 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  27.46 
 
 		 873 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  25.56 
 
 		 554 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  23.64 
 
 		 522 aa  46.2  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  34.43 
 
 		 518 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  26.38 
 
 		 494 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  22.88 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  25.32 
 
 		 501 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  28 
 
 		 708 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  22.52 
 
 		 528 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  26.62 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  27.17 
 
 		 827 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  22.58 
 
 		 537 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  25.68 
 
 		 515 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  23.18 
 
 		 518 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  23.18 
 
 		 518 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  22.58 
 
 		 537 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  28.65 
 
 		 489 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  27.75 
 
 		 863 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  28.35 
 
 		 863 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  27.75 
 
 		 910 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2274  type I restriction-modification system DNA methylase  23.84 
 
 		 527 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2182  type I restriction-modification system, M subunit  23.18 
 
 		 527 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>