More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1321 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
276 aa  564  1e-160  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  2.24332e-12 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 
286 aa  197  1e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 
280 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 
344 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
281 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  39.54 
 
 
291 aa  184  1e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 
291 aa  184  1e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  37.91 
 
 
273 aa  184  2e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  40.68 
 
 
291 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.89 
 
 
273 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
300 aa  182  4e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 
276 aa  182  4e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 
291 aa  182  5e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 
291 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.42979e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  40.68 
 
 
281 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  40.68 
 
 
291 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  40.68 
 
 
291 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
269 aa  179  5e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  40.3 
 
 
291 aa  178  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  39.16 
 
 
291 aa  178  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.01 
 
 
271 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
278 aa  175  8e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  38.64 
 
 
280 aa  174  1e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  35.97 
 
 
287 aa  172  4e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
286 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  37 
 
 
279 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 
278 aa  169  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 
314 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  36.86 
 
 
279 aa  169  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
317 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
271 aa  167  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  35.79 
 
 
283 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 
278 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 
338 aa  166  3e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
282 aa  166  3e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  34.06 
 
 
276 aa  164  1e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.49 
 
 
285 aa  164  1e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 
286 aa  164  2e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  35.83 
 
 
275 aa  164  2e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  35.89 
 
 
277 aa  164  2e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 
277 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
272 aa  163  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
277 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 
286 aa  162  5e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  2.00632e-05 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
272 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 
284 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
267 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
291 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.74 
 
 
272 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  38.63 
 
 
283 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  38.63 
 
 
283 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.95 
 
 
275 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
305 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
289 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
291 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
272 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 
273 aa  157  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  4.06118e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
272 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
306 aa  155  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.17 
 
 
271 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
285 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
268 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
307 aa  153  3e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 
272 aa  153  3e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 
272 aa  153  3e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
267 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
271 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
267 aa  152  6e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
268 aa  152  9e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
268 aa  152  9e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.89 
 
 
268 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
298 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
307 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
307 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.81 
 
 
268 aa  149  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  35.08 
 
 
272 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  39.89 
 
 
274 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  37.77 
 
 
268 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.18039e-13  hitchhiker  1.72259e-06 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 
271 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 
270 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  39.32 
 
 
268 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
268 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
282 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
291 aa  148  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
266 aa  147  1e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
268 aa  147  1e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
282 aa  148  1e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
284 aa  147  1e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  32.58 
 
 
282 aa  147  2e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
282 aa  147  2e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.82 
 
 
272 aa  147  2e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
282 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
279 aa  145  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
272 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
268 aa  145  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
293 aa  145  7e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  37.77 
 
 
304 aa  145  9e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.89 
 
 
264 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
287 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
292 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>