202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4927 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  48.52 
 
 
780 aa  730    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  64.03 
 
 
749 aa  953    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  62.62 
 
 
804 aa  901    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  63.49 
 
 
766 aa  948    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  53.18 
 
 
772 aa  865    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  54.01 
 
 
772 aa  875    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  54.13 
 
 
772 aa  875    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  61.33 
 
 
681 aa  839    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  52.85 
 
 
772 aa  881    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  54.13 
 
 
772 aa  875    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  52.9 
 
 
770 aa  843    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  61.24 
 
 
771 aa  960    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  56.6 
 
 
779 aa  854    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  61.17 
 
 
775 aa  944    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  53.5 
 
 
772 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  51.03 
 
 
775 aa  855    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  53.14 
 
 
764 aa  864    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  53.31 
 
 
772 aa  869    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  49.37 
 
 
712 aa  710    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  100 
 
 
777 aa  1574    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  53.63 
 
 
772 aa  870    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  51.37 
 
 
823 aa  736    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  53.63 
 
 
772 aa  868    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  53.56 
 
 
763 aa  857    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  58.91 
 
 
775 aa  903    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  53.5 
 
 
772 aa  866    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  53.14 
 
 
764 aa  859    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  62.09 
 
 
763 aa  868    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  53.63 
 
 
772 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  53.88 
 
 
772 aa  874    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  53.88 
 
 
772 aa  873    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  58.64 
 
 
760 aa  863    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  53.63 
 
 
772 aa  868    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  62.9 
 
 
760 aa  936    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  62.93 
 
 
774 aa  957    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  51.36 
 
 
780 aa  803    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  54.01 
 
 
772 aa  875    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  39.68 
 
 
760 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  42.37 
 
 
608 aa  473  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  38.95 
 
 
765 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  39.24 
 
 
765 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  34.65 
 
 
757 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  35.91 
 
 
799 aa  378  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  35.67 
 
 
794 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  39.2 
 
 
795 aa  363  7.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  35.32 
 
 
778 aa  333  7.000000000000001e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  34.84 
 
 
695 aa  317  6e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  30.38 
 
 
784 aa  314  4.999999999999999e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  28.91 
 
 
752 aa  290  9e-77  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  31.55 
 
 
828 aa  279  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  30.02 
 
 
770 aa  270  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  29.99 
 
 
803 aa  266  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  31.53 
 
 
779 aa  266  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  27.56 
 
 
755 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  28.07 
 
 
768 aa  263  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  27.1 
 
 
792 aa  261  4e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  27.21 
 
 
779 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  28.9 
 
 
836 aa  259  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  28.83 
 
 
746 aa  248  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  28.85 
 
 
801 aa  240  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  27.04 
 
 
821 aa  238  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  27.38 
 
 
794 aa  234  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  29.45 
 
 
785 aa  233  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  27.11 
 
 
797 aa  232  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  29.42 
 
 
779 aa  231  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  28.32 
 
 
799 aa  227  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  25 
 
 
776 aa  226  9e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  24.92 
 
 
752 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  27.36 
 
 
743 aa  221  5e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  27.03 
 
 
836 aa  214  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  24.07 
 
 
777 aa  213  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  28.4 
 
 
806 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  25.9 
 
 
839 aa  208  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  26.85 
 
 
798 aa  204  4e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 
813 aa  203  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  26.91 
 
 
661 aa  202  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  28.68 
 
 
803 aa  200  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  25.35 
 
 
700 aa  196  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  24.85 
 
 
692 aa  196  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  26.21 
 
 
845 aa  195  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  27.32 
 
 
656 aa  194  7e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  29.22 
 
 
695 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  26.93 
 
 
806 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  27.18 
 
 
828 aa  189  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  25.13 
 
 
1024 aa  188  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  28.33 
 
 
815 aa  188  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 
806 aa  188  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 
806 aa  188  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  26.52 
 
 
806 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  29.29 
 
 
690 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  27.14 
 
 
816 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  28.4 
 
 
679 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  28.01 
 
 
806 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  26.67 
 
 
668 aa  186  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  27.11 
 
 
699 aa  185  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  28.4 
 
 
679 aa  185  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  27.7 
 
 
806 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  28.06 
 
 
679 aa  183  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  28.23 
 
 
679 aa  183  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  26.13 
 
 
821 aa  183  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>