More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2189 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
496 aa  944  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  6.83339e-07  hitchhiker  0.000292513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.68 
 
 
408 aa  245  1e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  41.69 
 
 
409 aa  236  1e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0623  histidine kinase  39.09 
 
 
403 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 
442 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0235  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  39.49 
 
 
435 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
404 aa  135  1e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  40.74 
 
 
395 aa  130  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
449 aa  129  1e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
418 aa  129  2e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 
406 aa  127  4e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
394 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
398 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  36.07 
 
 
399 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
417 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  36.86 
 
 
430 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
403 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  38.57 
 
 
402 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  34.12 
 
 
379 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  38.86 
 
 
442 aa  122  1e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  36.92 
 
 
433 aa  121  2e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.4 
 
 
406 aa  120  5e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.1 
 
 
430 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
405 aa  119  1e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  40.28 
 
 
426 aa  119  1e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
496 aa  119  1e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.78 
 
 
370 aa  118  2e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  38.79 
 
 
399 aa  118  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
441 aa  117  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  37.96 
 
 
417 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  37.5 
 
 
387 aa  117  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.02 
 
 
422 aa  116  8e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  39.41 
 
 
372 aa  116  1e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  36.02 
 
 
395 aa  115  2e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  39.3 
 
 
393 aa  114  4e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  37.23 
 
 
408 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  37.02 
 
 
381 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  33.18 
 
 
414 aa  113  1e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  35.82 
 
 
408 aa  112  1e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  39.07 
 
 
422 aa  112  2e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  38.83 
 
 
449 aa  111  2e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  4.13704e-05 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  33.83 
 
 
403 aa  112  2e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  34.48 
 
 
399 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.72 
 
 
407 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  38.83 
 
 
428 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
536 aa  110  4e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
500 aa  110  4e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
421 aa  110  7e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  35.75 
 
 
442 aa  110  7e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  36.23 
 
 
438 aa  110  7e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  35.51 
 
 
405 aa  110  8e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  37.56 
 
 
393 aa  109  9e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
382 aa  110  9e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  36 
 
 
410 aa  109  9e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  38.35 
 
 
438 aa  109  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
416 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  36.23 
 
 
423 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  35.98 
 
 
428 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  36.8 
 
 
367 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
386 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  33.88 
 
 
421 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  33.18 
 
 
399 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  37.38 
 
 
388 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  32.28 
 
 
430 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  30.53 
 
 
478 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  33.78 
 
 
384 aa  106  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  40.1 
 
 
457 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.17 
 
 
392 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  37.1 
 
 
447 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
391 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2226  histidine kinase  33.33 
 
 
370 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  33.33 
 
 
402 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
382 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
441 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33 
 
 
401 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  36.24 
 
 
402 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2556  histidine kinase  40.74 
 
 
416 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35 
 
 
443 aa  104  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2538  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
396 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4946  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
793 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137067  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.71 
 
 
380 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  33.64 
 
 
470 aa  103  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  38.73 
 
 
419 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
438 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  31.88 
 
 
462 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.98 
 
 
378 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5263  histidine kinase  30.51 
 
 
518 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  35.29 
 
 
393 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  35.96 
 
 
446 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
387 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.91 
 
 
376 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  34.02 
 
 
422 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
360 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
394 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  34.18 
 
 
414 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
612 aa  100  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
392 aa  100  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
424 aa  100  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
420 aa  100  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
389 aa  100  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>