More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0265 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  100 
 
 
257 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  67.47 
 
 
291 aa  331  6e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  47.65 
 
 
354 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  32 
 
 
244 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  37.78 
 
 
317 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  30.29 
 
 
245 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  35.48 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  40.58 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2080  methyltransferase type 12  33.13 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  27.6 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  32.58 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  38.53 
 
 
2490 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0121  methyltransferase type 12  26.19 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.333152 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  44.86 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  33.97 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.72 
 
 
205 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  29.35 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.87 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  41.8 
 
 
634 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  34.59 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  35.83 
 
 
196 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  38.6 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.51 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  35.85 
 
 
202 aa  63.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  34.87 
 
 
274 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  40.74 
 
 
285 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 
200 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 
200 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 
274 aa  63.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  43.93 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  36.67 
 
 
196 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
202 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
286 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
244 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  36.91 
 
 
297 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  42.98 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.39 
 
 
278 aa  62.4  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  43.93 
 
 
228 aa  62  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  38 
 
 
422 aa  62.4  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  40.95 
 
 
236 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  30.99 
 
 
339 aa  62  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  29.57 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  43.93 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  35.76 
 
 
276 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.54 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  39.82 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  41.32 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.06 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  35 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.83 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1296  hypothetical protein  30 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0615608  normal  0.430138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1703  hypothetical protein  29.03 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.21 
 
 
330 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  28.93 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  38.4 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  37.96 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.83 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
232 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 
187 aa  60.1  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  34.31 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.95 
 
 
230 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2104  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0094319  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  35.9 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0962  Methyltransferase type 11  39.52 
 
 
298 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  35 
 
 
196 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  31.33 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  38.22 
 
 
291 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 
675 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.46 
 
 
234 aa  59.3  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  30.69 
 
 
290 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 
199 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  30.69 
 
 
290 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  31.73 
 
 
290 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  27.92 
 
 
295 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
257 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  36.62 
 
 
268 aa  58.5  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  34.33 
 
 
284 aa  58.5  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  31.25 
 
 
304 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
348 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  27.83 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  32.59 
 
 
240 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4181  methyltransferase type 11  37.62 
 
 
239 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.79 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  34.09 
 
 
217 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.85 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  28.45 
 
 
220 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  28.45 
 
 
220 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.63 
 
 
234 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  32.37 
 
 
351 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  31.65 
 
 
351 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  35.96 
 
 
213 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  39.69 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  28.45 
 
 
220 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>