131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0007 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  100 
 
 		 396 aa  821    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  57.14 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  56.18 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  55.11 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  44.23 
 
 		 391 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  42.74 
 
 		 391 aa  316  6e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  43.72 
 
 		 391 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  42.74 
 
 		 391 aa  311  9e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  42.74 
 
 		 391 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  42.47 
 
 		 391 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  43.84 
 
 		 391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_004310  BR0586  HK97 family portal protein  41.49 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0587  HK97 family phage portal protein  41.49 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3916  HK97 family phage portal protein  42.66 
 
 		 384 aa  295  6e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0348958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3150  HK97 family phage portal protein  40.83 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273725  normal  0.0302627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  42.02 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  41.07 
 
 		 400 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1429  phage portal protein, HK97 family  42.42 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.284789 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  39.67 
 
 		 400 aa  277  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3705  HK97 family phage portal protein  39.04 
 
 		 477 aa  273  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1433  HK97 family phage portal protein  40.66 
 
 		 390 aa  272  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.273066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  37.01 
 
 		 401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1707  phage portal protein, HK97 family  40.93 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.449207  normal  0.0531802 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1130  HK97 family phage portal protein  37.18 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.868122  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2468  putative portal protein  36.92 
 
 		 391 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2177  putative phage portal protein  39.33 
 
 		 396 aa  259  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4963  HK97 family phage portal protein  38.98 
 
 		 397 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373526 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1075  HK97 family phage portal protein  37.98 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.529897  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3119  Phage portal protein, HK97  38.31 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2002  Phage portal protein, HK97  37.96 
 
 		 368 aa  212  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443505  hitchhiker  0.004041 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0919  HK97 family phage portal protein  39.87 
 
 		 351 aa  209  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.38293 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  32.46 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  26.85 
 
 		 404 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  26.03 
 
 		 444 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  25.14 
 
 		 421 aa  92.8  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  27.1 
 
 		 434 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  26.57 
 
 		 420 aa  89.7  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  26.19 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  25.16 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  23.61 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  25.77 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  25.36 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  25.36 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  24.04 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  25.26 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2854  portal protein  24.56 
 
 		 1102 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279665  hitchhiker  0.00446406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  26.26 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  27.22 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  24.71 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  25.44 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  23.78 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  22.96 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  23.5 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3880  portal protein  24.3 
 
 		 479 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100107  normal  0.024166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  23.87 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  23.5 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  22.96 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  22.64 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  22.05 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  22.38 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  23.92 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  22.51 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  22.79 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  22.67 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  24.08 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  23.29 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  22.47 
 
 		 416 aa  67  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  25.18 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  25.08 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  21.22 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  21.22 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  22.07 
 
 		 544 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  24.43 
 
 		 833 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  24.43 
 
 		 859 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  25.44 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  24.43 
 
 		 833 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  25.07 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  23.49 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  22.7 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  23.66 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3484  portal protein  21.73 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  27.22 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  25 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  21.7 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  22.27 
 
 		 457 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  23.97 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  26.35 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  23.83 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0650  phage portal protein  31.11 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  23.83 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  25.07 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  23.31 
 
 		 454 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  23.31 
 
 		 454 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  24.23 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  23.15 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  22.15 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  22.15 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  22.15 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  23.72 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  24.91 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>