36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0255 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  100 
 
 		 495 aa  1031    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  44.85 
 
 		 518 aa  432  1e-120  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  48.06 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  43.84 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  46.62 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  40.24 
 
 		 484 aa  363  5.0000000000000005e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  46.21 
 
 		 407 aa  360  4e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  43.57 
 
 		 580 aa  351  2e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  44.99 
 
 		 407 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  45.23 
 
 		 407 aa  347  3e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  46.28 
 
 		 457 aa  345  8.999999999999999e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  44.5 
 
 		 407 aa  343  5e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  40.37 
 
 		 447 aa  342  7e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  45.57 
 
 		 457 aa  332  7.000000000000001e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  44.92 
 
 		 456 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  45.69 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  37.71 
 
 		 484 aa  318  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  40.05 
 
 		 397 aa  310  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  40.55 
 
 		 428 aa  299  7e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  38.15 
 
 		 448 aa  268  2e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  37.16 
 
 		 487 aa  259  8e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  37.84 
 
 		 416 aa  256  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  33.5 
 
 		 395 aa  229  7e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  30.71 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  27.33 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  30.84 
 
 		 376 aa  159  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0531  glycoside hydrolase family 57  23.13 
 
 		 361 aa  52.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  25.18 
 
 		 729 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  23.31 
 
 		 732 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  25.47 
 
 		 238 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  23.5 
 
 		 1000 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  22.94 
 
 		 734 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 		 722 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  19.42 
 
 		 749 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  19.42 
 
 		 749 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  25.76 
 
 		 1006 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>