More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0799 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  100 
 
 		 701 aa  1410    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  64.27 
 
 		 712 aa  913    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  55.59 
 
 		 596 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  55.02 
 
 		 596 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  42.96 
 
 		 704 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  43.2 
 
 		 704 aa  537  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  43.2 
 
 		 712 aa  537  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  45.11 
 
 		 708 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  43.32 
 
 		 713 aa  520  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  45.92 
 
 		 588 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  45.27 
 
 		 579 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  44.03 
 
 		 586 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  43.52 
 
 		 583 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  43.68 
 
 		 606 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  41.27 
 
 		 610 aa  445  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  40.86 
 
 		 613 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  44.31 
 
 		 630 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  41.11 
 
 		 575 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  40.6 
 
 		 614 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  40.78 
 
 		 588 aa  424  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  41.3 
 
 		 593 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.77 
 
 		 587 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  40.1 
 
 		 621 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  40.77 
 
 		 587 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  38.45 
 
 		 590 aa  391  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  40.7 
 
 		 577 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  36.64 
 
 		 602 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  36.59 
 
 		 605 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  39.52 
 
 		 614 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  36.42 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  39.23 
 
 		 614 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  36.26 
 
 		 626 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  40.35 
 
 		 572 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  39.35 
 
 		 595 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  37.41 
 
 		 577 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  39.05 
 
 		 588 aa  382  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  37.95 
 
 		 636 aa  382  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  38.43 
 
 		 589 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  38.43 
 
 		 589 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  38.43 
 
 		 589 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  38.33 
 
 		 589 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.98 
 
 		 589 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  38.33 
 
 		 589 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  38.1 
 
 		 578 aa  379  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  38.25 
 
 		 583 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 588 aa  376  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.05 
 
 		 588 aa  376  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 588 aa  376  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 588 aa  376  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.87 
 
 		 588 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.05 
 
 		 588 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.5 
 
 		 592 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.77 
 
 		 598 aa  373  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.05 
 
 		 584 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  39.26 
 
 		 614 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  35.71 
 
 		 606 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  36.93 
 
 		 589 aa  369  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  37.29 
 
 		 563 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  36.62 
 
 		 597 aa  352  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  33.49 
 
 		 636 aa  350  6e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  35.95 
 
 		 595 aa  349  9e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  33.49 
 
 		 636 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.23 
 
 		 599 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  33.49 
 
 		 634 aa  348  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  33.61 
 
 		 635 aa  342  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  35.33 
 
 		 553 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  35.04 
 
 		 674 aa  330  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  35.7 
 
 		 666 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  34.56 
 
 		 637 aa  325  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  33.49 
 
 		 626 aa  321  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  35.06 
 
 		 642 aa  317  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  34.87 
 
 		 557 aa  317  5e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  35 
 
 		 651 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  34.9 
 
 		 591 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  34.05 
 
 		 660 aa  314  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  33.51 
 
 		 600 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  32.37 
 
 		 639 aa  312  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  37.78 
 
 		 603 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2853  ABC transporter related  31.63 
 
 		 670 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2897  ABC transporter  31.63 
 
 		 670 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  33.95 
 
 		 557 aa  303  7.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3163  ABC transporter  34.74 
 
 		 632 aa  301  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705565  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3409  ABC transporter  33.04 
 
 		 633 aa  294  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  33.98 
 
 		 560 aa  289  9e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  31.58 
 
 		 667 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0863  ABC transporter domain protein  31.77 
 
 		 602 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  32.75 
 
 		 665 aa  285  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  32.89 
 
 		 608 aa  282  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07140  ABC-type transport system permease and ATPase component  31.94 
 
 		 588 aa  280  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0603  ABC transporter domain protein  33.58 
 
 		 596 aa  278  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4936  ABC transporter  32.3 
 
 		 606 aa  277  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00595955  normal  0.404726 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  34.27 
 
 		 576 aa  275  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  31.14 
 
 		 663 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  31.14 
 
 		 663 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  32.39 
 
 		 668 aa  271  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2150  ABC transporter related protein  30.37 
 
 		 561 aa  270  8.999999999999999e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1686  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein yddA  30.37 
 
 		 561 aa  269  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2161  ABC transporter related  30.37 
 
 		 561 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.918171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  34.82 
 
 		 603 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2109  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  30.37 
 
 		 561 aa  269  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.356794  normal  0.522774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>