More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1528 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1528  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  798    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.275544 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  40.19 
 
 
398 aa  263  4.999999999999999e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  28.71 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  24.71 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 
419 aa  113  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  28 
 
 
397 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  25.98 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  25.76 
 
 
397 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  24.76 
 
 
387 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1742  protein of unknown function DUF214  29.38 
 
 
418 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  27.76 
 
 
407 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  27.73 
 
 
400 aa  107  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  27.35 
 
 
397 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  27.84 
 
 
410 aa  106  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  25.88 
 
 
397 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  27.01 
 
 
384 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.87 
 
 
397 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  27.84 
 
 
410 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  29.28 
 
 
414 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  27.19 
 
 
405 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1006  hypothetical protein  28.13 
 
 
401 aa  105  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  26.94 
 
 
414 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0770  hypothetical protein  27.29 
 
 
425 aa  103  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.534854  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  28.31 
 
 
397 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  26.06 
 
 
397 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 
467 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2608  protein of unknown function DUF214  26.46 
 
 
395 aa  103  8e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  27.73 
 
 
398 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  27.06 
 
 
397 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  27.56 
 
 
409 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  26.09 
 
 
409 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  25.33 
 
 
420 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.67 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  25.17 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  24.17 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0746  putative ABC transport system permease protein  24.94 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.489511 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  27.8 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  24.89 
 
 
653 aa  97.8  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  27.08 
 
 
400 aa  97.4  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  28.28 
 
 
400 aa  96.3  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  26.17 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  27.27 
 
 
394 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.81 
 
 
413 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  25.28 
 
 
404 aa  94.4  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.92 
 
 
424 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 
405 aa  94  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  24.59 
 
 
404 aa  94.4  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  25.28 
 
 
404 aa  93.6  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  27.17 
 
 
399 aa  94  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.01 
 
 
416 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  26.62 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  25.23 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  24.48 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  24.4 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.26 
 
 
416 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  24.32 
 
 
420 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 
409 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  26.57 
 
 
397 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  26.48 
 
 
405 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 
409 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  26.48 
 
 
405 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 
418 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  26.21 
 
 
399 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.23 
 
 
423 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  26.98 
 
 
386 aa  90.9  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  26.24 
 
 
643 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  23.98 
 
 
407 aa  90.1  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  25.45 
 
 
651 aa  89.7  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  30.45 
 
 
430 aa  89.7  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  24.26 
 
 
405 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  25.68 
 
 
409 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  25.88 
 
 
409 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  26.61 
 
 
405 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.46 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  25.36 
 
 
392 aa  89  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  25.75 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  25.06 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  26.19 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 
420 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  24.26 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  25.61 
 
 
409 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  26.4 
 
 
402 aa  88.2  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  23.65 
 
 
397 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  26.83 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  22.56 
 
 
371 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  24.47 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  26.19 
 
 
409 aa  86.7  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.23 
 
 
385 aa  86.7  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  27.55 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  25.23 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  26.35 
 
 
652 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  25 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  23.86 
 
 
420 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  25.75 
 
 
845 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.56 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  28.93 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  25.64 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  23.5 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  22.2 
 
 
849 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  25.27 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>