More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1098 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1098  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
305 aa  617  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680676  normal  0.149634 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2290  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  80.59 
 
 
312 aa  507  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  56.81 
 
 
311 aa  322  3e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3103  agmatinase  37.33 
 
 
323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0277  agmatinase  37.09 
 
 
322 aa  192  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.17372 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1151  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.54 
 
 
329 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1883  arginase family protein  34.49 
 
 
337 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1578  agmatinase  34.53 
 
 
318 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1957  arginase family protein  34.15 
 
 
337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  34.2 
 
 
316 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  34.53 
 
 
316 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  37.1 
 
 
333 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  33.33 
 
 
315 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  34.11 
 
 
310 aa  154  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  32.57 
 
 
354 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  32.57 
 
 
354 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  32.89 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  31.68 
 
 
329 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  32.46 
 
 
319 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  32.24 
 
 
318 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  32.57 
 
 
318 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  32.79 
 
 
318 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  32.01 
 
 
342 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  32.24 
 
 
329 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  32.46 
 
 
318 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  35.38 
 
 
345 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  36.18 
 
 
315 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  36.69 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  31.89 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  31.48 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  34.15 
 
 
369 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  32.14 
 
 
319 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  32.25 
 
 
317 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  32.25 
 
 
317 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  32.25 
 
 
317 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  32.25 
 
 
317 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  32.25 
 
 
317 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  31.69 
 
 
330 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  32.25 
 
 
317 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  34.3 
 
 
316 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  32.58 
 
 
345 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  31.27 
 
 
320 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  33.23 
 
 
340 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  31.7 
 
 
319 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  33.22 
 
 
319 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  33.22 
 
 
319 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  33.22 
 
 
319 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  32.01 
 
 
299 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  32.26 
 
 
345 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  32.26 
 
 
345 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  32.25 
 
 
320 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1954  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.22 
 
 
303 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  31.27 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  34.49 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  32.67 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  34.6 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  31.27 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  30.94 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  32.05 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  30.49 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  30.94 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  35.62 
 
 
313 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  31.7 
 
 
315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  32.35 
 
 
354 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  32.04 
 
 
478 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  32.13 
 
 
329 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  29.64 
 
 
318 aa  139  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  32.79 
 
 
321 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2237  agmatinase  32.43 
 
 
303 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.972034  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  32.46 
 
 
337 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  32.03 
 
 
378 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  30.62 
 
 
319 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  32.24 
 
 
326 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  31.58 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  32.24 
 
 
326 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  30.99 
 
 
322 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  33.01 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  32.24 
 
 
326 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  33.01 
 
 
317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  33.22 
 
 
334 aa  135  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  33.22 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1777  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.23 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  0.0243796 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  31.25 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  32.13 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  33.66 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  32.57 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  34.81 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  34.42 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  31.91 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  33.65 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  32.49 
 
 
351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  33.33 
 
 
351 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  32.8 
 
 
354 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.51 
 
 
335 aa  132  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  32.14 
 
 
340 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  29.64 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  29.63 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  30.26 
 
 
321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  32.67 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  33.75 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>