More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6184 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
374 aa  736    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  62.28 
 
 
296 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  57.88 
 
 
356 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  53.24 
 
 
297 aa  303  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  53.31 
 
 
289 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  50.72 
 
 
284 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  50.72 
 
 
283 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  49.82 
 
 
296 aa  293  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  51.99 
 
 
281 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  51.84 
 
 
308 aa  289  7e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  51.25 
 
 
323 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  48.41 
 
 
296 aa  286  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  51.27 
 
 
284 aa  285  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  50.88 
 
 
311 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  51.8 
 
 
336 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  51.8 
 
 
334 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.39 
 
 
639 aa  276  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  50 
 
 
284 aa  275  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  51.08 
 
 
336 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  47.83 
 
 
290 aa  272  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  48.74 
 
 
293 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  50.55 
 
 
323 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  47.84 
 
 
293 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  43.84 
 
 
321 aa  263  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  48.01 
 
 
321 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  46.69 
 
 
296 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  48.38 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  46.07 
 
 
300 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45.68 
 
 
290 aa  249  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  46.93 
 
 
290 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  46.93 
 
 
290 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  46.93 
 
 
290 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  44.04 
 
 
324 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  43.73 
 
 
303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  48.21 
 
 
289 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  48.36 
 
 
296 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  43.64 
 
 
288 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  44.19 
 
 
329 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  41.28 
 
 
315 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  43.68 
 
 
287 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  41.64 
 
 
301 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  46.59 
 
 
293 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  47.83 
 
 
294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  41.43 
 
 
306 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  47.14 
 
 
300 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  37.58 
 
 
323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  35.55 
 
 
323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  40.55 
 
 
309 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  38.83 
 
 
283 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  42.65 
 
 
305 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  40.93 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  36.27 
 
 
313 aa  200  3.9999999999999996e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  39.72 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 
335 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 
289 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 
290 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 
296 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
297 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  50.82 
 
 
409 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  52.75 
 
 
99 aa  100  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  30.58 
 
 
286 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3408  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  82.8  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337254  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  29.45 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
294 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  29.24 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  40.18 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.32 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  37.4 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  36.8 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  29.02 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25.94 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  40.18 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  36.36 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
287 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
292 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  38.05 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  24.74 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  36.97 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  39.5 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>