80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3981 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  54.1 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  53.55 
 
 		 207 aa  204  9e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  50.27 
 
 		 204 aa  190  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.69 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  48.63 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  47.31 
 
 		 185 aa  151  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.71 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  55.15 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  47.48 
 
 		 149 aa  144  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  51.47 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  51.47 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  51.47 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  47.02 
 
 		 184 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  39.34 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  50.74 
 
 		 184 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  50.74 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  52.21 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  50.74 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  50.74 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  50.74 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  44 
 
 		 193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44 
 
 		 193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  38.04 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  50.74 
 
 		 187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  49.26 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.08 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  39.73 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  41.1 
 
 		 185 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  35.66 
 
 		 181 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  32.6 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.96 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  32.76 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  30.86 
 
 		 181 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  31.25 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.17 
 
 		 181 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.37 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  28.28 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  32.61 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  32.61 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  30.46 
 
 		 859 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  27.96 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  30.11 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  32.35 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  28.47 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  30.5 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  30.5 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  30.5 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3269  hypothetical protein  27.27 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  26.21 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.67 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  29.5 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  31.13 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  32.68 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  24.22 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.47 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  29.01 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  29.5 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.01 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  29.01 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  29.01 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  28.21 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  26.32 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  27.2 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  29.1 
 
 		 185 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  29.55 
 
 		 193 aa  44.7  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.72 
 
 		 186 aa  44.7  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  26.45 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  28.46 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  29.01 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.84 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  27.5 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  28.16 
 
 		 172 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1341  alkylhydroperoxidase  30.69 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.728032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  24.82 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  27.05 
 
 		 176 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  27.05 
 
 		 176 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  27.05 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>