166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1770 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  74.39 
 
 
577 aa  789  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  100 
 
 
571 aa  1140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  47.14 
 
 
583 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  1.22606e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  35.93 
 
 
997 aa  273  5e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  34.48 
 
 
570 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  34.76 
 
 
562 aa  222  1e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  34.44 
 
 
559 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  34.06 
 
 
570 aa  215  2e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  34.02 
 
 
561 aa  214  3e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  32.66 
 
 
566 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  37.03 
 
 
578 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  38.55 
 
 
274 aa  129  2e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  39.01 
 
 
274 aa  123  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  39.01 
 
 
274 aa  122  1e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  35 
 
 
283 aa  117  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  35.86 
 
 
285 aa  112  2e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  35.86 
 
 
285 aa  112  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  35.04 
 
 
285 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  36.1 
 
 
288 aa  107  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  36.21 
 
 
277 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  36.68 
 
 
279 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  36.54 
 
 
288 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  37.27 
 
 
278 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  31.52 
 
 
240 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  31.13 
 
 
240 aa  100  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  33.67 
 
 
302 aa  100  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  35.95 
 
 
287 aa  100  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  37.79 
 
 
276 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  34.48 
 
 
288 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  32.05 
 
 
261 aa  99  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  37.17 
 
 
276 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18187e-05 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0836  porin  40.84 
 
 
254 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0404918  normal  0.853535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  37.07 
 
 
287 aa  94  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  33.99 
 
 
296 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  33.99 
 
 
296 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  35.41 
 
 
289 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.29 
 
 
236 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  35.41 
 
 
289 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  39.78 
 
 
246 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  35.13 
 
 
447 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  36.92 
 
 
234 aa  91.3  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  34.55 
 
 
453 aa  90.5  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  30.63 
 
 
692 aa  89  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  30.17 
 
 
237 aa  89.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3848  porin  35.56 
 
 
287 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  29.43 
 
 
225 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  36.56 
 
 
255 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  32.6 
 
 
452 aa  88.2  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  32.53 
 
 
255 aa  88.2  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.99 
 
 
243 aa  87.8  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  33.33 
 
 
279 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  33.88 
 
 
299 aa  87  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  29.75 
 
 
250 aa  86.7  1e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3321  porin  37.25 
 
 
285 aa  85.5  2e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  30.6 
 
 
284 aa  85.9  2e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  34.1 
 
 
296 aa  85.5  3e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  34.58 
 
 
290 aa  85.1  3e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  34.58 
 
 
290 aa  85.1  3e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  31.91 
 
 
207 aa  84.3  5e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  30.89 
 
 
248 aa  84  8e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  30.95 
 
 
258 aa  83.6  9e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  29.96 
 
 
244 aa  83.2  1e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  38.81 
 
 
243 aa  82.8  1e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  34.24 
 
 
290 aa  82.8  2e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2044  porin  36.17 
 
 
294 aa  81.6  3e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4466  porin  34.41 
 
 
288 aa  80.9  6e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  30.74 
 
 
237 aa  80.5  7e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  32.18 
 
 
236 aa  80.5  8e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4355  porin  34.14 
 
 
288 aa  79.7  1e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.64859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  29.74 
 
 
251 aa  80.1  1e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3986  porin  34.14 
 
 
288 aa  79.7  1e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0565804  normal  0.846216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  31.72 
 
 
240 aa  79  2e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  32.49 
 
 
302 aa  79.3  2e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  32.92 
 
 
236 aa  79.3  2e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  32.08 
 
 
255 aa  79.3  2e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  28.46 
 
 
242 aa  77.8  5e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  34.26 
 
 
294 aa  77.8  5e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  35.03 
 
 
238 aa  77.4  6e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  27.57 
 
 
245 aa  77  8e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  34.43 
 
 
454 aa  77  8e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1624  porin  34.18 
 
 
285 aa  76.3  1e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  30.88 
 
 
254 aa  74.7  4e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  27.2 
 
 
232 aa  74.3  5e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3415  putative outer membrane protein of unknown function  31.14 
 
 
680 aa  74.3  6e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154801  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  35.52 
 
 
449 aa  74.3  6e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  28.57 
 
 
238 aa  73.9  8e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  29.43 
 
 
283 aa  72.8  1e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  33.68 
 
 
662 aa  72.8  1e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  30.09 
 
 
598 aa  72.8  2e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0187168  normal  0.160619 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  31.67 
 
 
674 aa  71.6  3e-11  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2142  porin  33.95 
 
 
284 aa  71.6  4e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7845  porin  33.2 
 
 
287 aa  70.9  6e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  28.79 
 
 
254 aa  70.9  6e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  30.49 
 
 
235 aa  70.5  7e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  28.77 
 
 
449 aa  69.7  1e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  30 
 
 
230 aa  69.7  1e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.09958e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  29.22 
 
 
245 aa  69.7  1e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  28.26 
 
 
693 aa  68.6  3e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.32 
 
 
240 aa  68.2  4e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  28.41 
 
 
241 aa  68.2  4e-10  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>