More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1652 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
327 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  68.79 
 
 
338 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  68.79 
 
 
338 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  65.09 
 
 
322 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  66.87 
 
 
338 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  64.38 
 
 
322 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  63.09 
 
 
327 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  64.04 
 
 
324 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  62.65 
 
 
334 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  64.15 
 
 
324 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  64.15 
 
 
324 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  63.34 
 
 
387 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  64.38 
 
 
322 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  63.99 
 
 
369 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  63.99 
 
 
369 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4876  AraC family transcriptional regulator  70.16 
 
 
321 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  63.99 
 
 
343 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  63.99 
 
 
346 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  63.99 
 
 
346 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  63.99 
 
 
346 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  63.05 
 
 
374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  55.73 
 
 
321 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  55.73 
 
 
321 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  55.73 
 
 
321 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  55.73 
 
 
321 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  55.73 
 
 
321 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  55.73 
 
 
321 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  54.55 
 
 
327 aa  318  6e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  52.04 
 
 
335 aa  291  7e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  45.74 
 
 
320 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  50.76 
 
 
338 aa  285  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  50.8 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  45.22 
 
 
320 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  46.96 
 
 
319 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  49.7 
 
 
351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  53.61 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  46.08 
 
 
325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  45.73 
 
 
341 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  47.35 
 
 
339 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 
328 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  45.06 
 
 
336 aa  264  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  47.65 
 
 
321 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  47.65 
 
 
321 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  45.69 
 
 
327 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  48.48 
 
 
334 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  49.35 
 
 
311 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  47.27 
 
 
363 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  49.35 
 
 
311 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  42.81 
 
 
341 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  48.17 
 
 
334 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  47.52 
 
 
338 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  47.02 
 
 
321 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  45.69 
 
 
319 aa  258  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  50.16 
 
 
310 aa  258  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  48.61 
 
 
357 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  44.11 
 
 
332 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  47.22 
 
 
327 aa  255  8e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  42.49 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1912  AraC family transcriptional regulator  59.91 
 
 
215 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  47.57 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  49.05 
 
 
321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2581  AraC family transcriptional regulator  45.25 
 
 
325 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0339755  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  47.34 
 
 
336 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4745  AraC family transcriptional regulator  47.34 
 
 
336 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3422  AraC family transcriptional regulator  47.34 
 
 
336 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  44.62 
 
 
329 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  44.51 
 
 
342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  48.89 
 
 
328 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2164  transcriptional regulator  49.09 
 
 
340 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.0201995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  45.77 
 
 
320 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  44.41 
 
 
319 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  47.02 
 
 
348 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  44.04 
 
 
334 aa  248  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  50.32 
 
 
320 aa  248  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  48.93 
 
 
330 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  46.98 
 
 
321 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  44.09 
 
 
319 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  50.86 
 
 
437 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  46.53 
 
 
375 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  42.81 
 
 
356 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  42.9 
 
 
349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  45.65 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  48.25 
 
 
319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  47.17 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  45.48 
 
 
336 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  46.1 
 
 
312 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  47.3 
 
 
324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  46.03 
 
 
321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  45.71 
 
 
321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  45.71 
 
 
321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
338 aa  242  7e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  46.28 
 
 
322 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  45.17 
 
 
362 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  48.2 
 
 
312 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  46.71 
 
 
334 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  46.69 
 
 
341 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  49.22 
 
 
326 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
331 aa  238  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
344 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  40.06 
 
 
330 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>