147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4827 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  100 
 
 
201 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  91.54 
 
 
201 aa  354  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  91.04 
 
 
201 aa  354  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2833  superoxide dismutase copper/zinc binding  76.25 
 
 
177 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  65.26 
 
 
177 aa  242  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  75.32 
 
 
179 aa  236  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2922  superoxide dismutase copper/zinc binding  55.1 
 
 
183 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719659  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  55.63 
 
 
179 aa  144  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  47.62 
 
 
176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  48.43 
 
 
172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  46.48 
 
 
169 aa  121  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.67 
 
 
172 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.16 
 
 
179 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  39.61 
 
 
174 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.5 
 
 
179 aa  101  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.5 
 
 
179 aa  101  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.5 
 
 
179 aa  101  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.18 
 
 
179 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.18 
 
 
179 aa  99.4  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.18 
 
 
179 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.18 
 
 
179 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.18 
 
 
179 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.18 
 
 
165 aa  99  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  40.28 
 
 
156 aa  95.5  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.95 
 
 
180 aa  95.5  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.86 
 
 
173 aa  94.4  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  35.62 
 
 
169 aa  92  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  33.33 
 
 
185 aa  92  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.79 
 
 
191 aa  91.7  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.14 
 
 
185 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.64 
 
 
172 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.62 
 
 
172 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.76 
 
 
190 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.44 
 
 
172 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.13 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.76 
 
 
171 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.76 
 
 
171 aa  84.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.37 
 
 
169 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  36.36 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.4 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  37.14 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  37.31 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.33 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.67 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.6 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  29.74 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  39.5 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  40 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.33 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.33 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  38.52 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  38.52 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  40.91 
 
 
171 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7975  Cu/Zn superoxide dismutase-like protein  30.54 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  0.114926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  30.88 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  30.9 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  35 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  37.19 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.79 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.41 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.11 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.08 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  38.05 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.51 
 
 
171 aa  64.3  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.01 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.58 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.89 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.82 
 
 
177 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.11 
 
 
170 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  33.11 
 
 
170 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  34.64 
 
 
172 aa  62.4  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.13 
 
 
180 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  33.56 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2767  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  29.82 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  30.61 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.61 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.92 
 
 
173 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0161  copper/zinc superoxide dismutase  35.9 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000919214  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  31.29 
 
 
171 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.21 
 
 
182 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  30 
 
 
173 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  36.36 
 
 
171 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.36 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0735  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.9 
 
 
235 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  34.44 
 
 
174 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.61 
 
 
183 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  34.78 
 
 
192 aa  58.5  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  31.86 
 
 
158 aa  58.5  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.69 
 
 
183 aa  58.2  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  27.6 
 
 
173 aa  58.2  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  27.6 
 
 
173 aa  58.2  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  32.43 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.17 
 
 
181 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.47 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  33.56 
 
 
173 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  30.07 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  33.55 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  32.47 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  32.68 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  32.47 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>