More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4654 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  69.02 
 
 		 708 aa  932    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  68.04 
 
 		 704 aa  948    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  67.9 
 
 		 712 aa  944    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  100 
 
 		 713 aa  1423    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  68.18 
 
 		 704 aa  947    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  51.53 
 
 		 596 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  43.2 
 
 		 712 aa  541  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  42.55 
 
 		 701 aa  529  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  50.52 
 
 		 596 aa  525  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  47.68 
 
 		 630 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  46.44 
 
 		 588 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  47.24 
 
 		 586 aa  509  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  47.17 
 
 		 583 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  46.39 
 
 		 579 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.82 
 
 		 587 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  41.82 
 
 		 587 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  42.83 
 
 		 593 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  42.93 
 
 		 610 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  42.49 
 
 		 606 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  41.29 
 
 		 575 aa  432  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  40.55 
 
 		 613 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  41.81 
 
 		 614 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  42.75 
 
 		 577 aa  425  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  42.59 
 
 		 614 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  40.28 
 
 		 588 aa  415  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  42.59 
 
 		 614 aa  412  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  41.54 
 
 		 626 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  41.73 
 
 		 615 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  41.65 
 
 		 602 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  43.69 
 
 		 595 aa  403  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  41.41 
 
 		 605 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  38.77 
 
 		 590 aa  399  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  40.55 
 
 		 589 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  42.97 
 
 		 614 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  41.25 
 
 		 606 aa  395  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  41.39 
 
 		 636 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  38.17 
 
 		 621 aa  392  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  39.69 
 
 		 589 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  39.86 
 
 		 589 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  39.69 
 
 		 589 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  39.69 
 
 		 589 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  39.86 
 
 		 589 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  41.3 
 
 		 578 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  39.13 
 
 		 563 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.61 
 
 		 588 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 		 588 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  40.48 
 
 		 583 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  39.86 
 
 		 589 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.61 
 
 		 588 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 		 588 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 		 588 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  40.82 
 
 		 592 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.61 
 
 		 584 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 577 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  42.56 
 
 		 572 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  40.07 
 
 		 588 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.43 
 
 		 588 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  37.48 
 
 		 595 aa  372  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.34 
 
 		 598 aa  371  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  39.96 
 
 		 636 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  39.77 
 
 		 634 aa  364  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  39.77 
 
 		 636 aa  364  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  38.81 
 
 		 597 aa  362  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  39.96 
 
 		 635 aa  361  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  38.1 
 
 		 599 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  37.2 
 
 		 639 aa  340  4e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  37.69 
 
 		 637 aa  336  9e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  35.53 
 
 		 642 aa  333  5e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  36.17 
 
 		 651 aa  333  9e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  34.88 
 
 		 591 aa  330  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  34.21 
 
 		 660 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  39.35 
 
 		 626 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  35.54 
 
 		 666 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  34.4 
 
 		 674 aa  318  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  36.31 
 
 		 553 aa  313  5.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07140  ABC-type transport system permease and ATPase component  36.09 
 
 		 588 aa  309  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  36.77 
 
 		 557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2853  ABC transporter related  36.84 
 
 		 670 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2897  ABC transporter  36.84 
 
 		 670 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  34.35 
 
 		 534 aa  305  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3409  ABC transporter  34.72 
 
 		 633 aa  304  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3163  ABC transporter  35.27 
 
 		 632 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705565  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  35.53 
 
 		 603 aa  303  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  38.53 
 
 		 557 aa  298  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0863  ABC transporter domain protein  35.78 
 
 		 602 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1490  transporter, putative  33.21 
 
 		 621 aa  295  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00776533  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1444  putative transporter  32.82 
 
 		 621 aa  293  5e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  33.76 
 
 		 665 aa  290  4e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  31.59 
 
 		 667 aa  290  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  34.23 
 
 		 567 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0407  ABC transporter domain protein  32.41 
 
 		 609 aa  288  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  33.97 
 
 		 667 aa  287  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3300  ABC transporter component  33.27 
 
 		 629 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1678  ABC transporter  32.25 
 
 		 623 aa  284  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  34.4 
 
 		 570 aa  283  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  33.54 
 
 		 600 aa  280  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.46 
 
 		 549 aa  280  9e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  34.09 
 
 		 560 aa  276  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  31.77 
 
 		 660 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  31.28 
 
 		 660 aa  275  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>