100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2540 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2540  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 88 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205995  normal  0.184829 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1008  Heavy metal transport/detoxification protein  46.43 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329666  normal  0.181285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  45.61 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  45.61 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  37.84 
 
 		 81 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  40.68 
 
 		 65 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  41.38 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  41.38 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  39.68 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 827 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  43.33 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  42.11 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0485  Heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.477053 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  49.18 
 
 		 827 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  40.35 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  58.33 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06720  copper chaperone  41.1 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00676012  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  41.94 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  40.35 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 939 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  45.71 
 
 		 1021 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 762 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 762 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0415  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341937 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 		 1182 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  41.43 
 
 		 762 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  41.43 
 
 		 767 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0448  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.268812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 		 835 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  45.71 
 
 		 1021 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  48.53 
 
 		 1040 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  47.69 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 791 aa  42.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 891 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 		 65 aa  42  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  41.38 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  38.36 
 
 		 961 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  38.89 
 
 		 955 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  38.36 
 
 		 955 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  38.55 
 
 		 841 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 1013 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0131  heavy metal transport/detoxification protein  39.71 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  38.14 
 
 		 819 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  41.43 
 
 		 762 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  29.89 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 70 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 		 66 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 66 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 790 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1368  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 		 946 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  49.23 
 
 		 804 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 		 937 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  47.54 
 
 		 840 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  55 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  51.79 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  49.18 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  42.25 
 
 		 835 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  40 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0643  hypothetical protein  38.71 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1836  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 808 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.048394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 		 64 aa  40  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  42.65 
 
 		 826 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 		 70 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 		 65 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 69 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>