51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0448 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0415  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 73 aa  144  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0448  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 73 aa  144  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.268812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0485  Heavy metal transport/detoxification protein  94.52 
 
 		 73 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.477053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  69.12 
 
 		 81 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  67.65 
 
 		 80 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4089  heavy metal transport/detoxification protein  61.64 
 
 		 73 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  41.82 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 79 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  37.1 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  40.3 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  36.67 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  36.67 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4881  heavy metal transport/detoxification protein  28.33 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4050  heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 814 aa  41.6  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  30.65 
 
 		 77 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  32.31 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0449  hypothetical protein  37.29 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68228e-19 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0408  hypothetical protein  37.29 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000230942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0389  hypothetical protein  37.29 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 818 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  33.9 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0386  hypothetical protein  37.29 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000012087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0394  hypothetical protein  37.29 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593872  hitchhiker  1.762e-17 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  32.2 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  32.2 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  30.56 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  31.82 
 
 		 942 aa  40.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  36.51 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3228  heavy metal transport/detoxification protein  40.74 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4415  heavy metal transport/detoxification protein  32.2 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3072  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 65 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.356914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>