84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4089 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4089  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 73 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0485  Heavy metal transport/detoxification protein  63.01 
 
 		 73 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.477053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0415  heavy metal transport/detoxification protein  61.64 
 
 		 73 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0448  Heavy metal transport/detoxification protein  61.64 
 
 		 73 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.268812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  60.87 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  57.97 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  41.94 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 65 aa  50.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  40.32 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4050  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  45.28 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4522  heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  43.4 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  35 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  38.33 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  45.76 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  38.33 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  33.9 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1654  Heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.529157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  34.43 
 
 		 471 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0386  hypothetical protein  42.11 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000012087 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4415  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  33.9 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0389  hypothetical protein  38.98 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0408  hypothetical protein  38.98 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000230942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0449  hypothetical protein  38.98 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68228e-19 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  38.18 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4881  heavy metal transport/detoxification protein  31.67 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  32.2 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1338  heavy metal-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3228  heavy metal transport/detoxification protein  42.59 
 
 		 71 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 		 726 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  35 
 
 		 78 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0394  hypothetical protein  40.35 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593872  hitchhiker  1.762e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  34.48 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  32.2 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1627  hypothetical protein  37.88 
 
 		 69 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  32.86 
 
 		 867 aa  40.8  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  33.33 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  40.35 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 709 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 891 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 829 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0383  heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 98 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 		 69 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>