48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3072 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3072  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
65 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.356914 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4881  heavy metal transport/detoxification protein  68.75 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3214  Heavy metal transport/detoxification protein  61.54 
 
 
65 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2906  Heavy metal transport/detoxification protein  61.54 
 
 
65 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0225  heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4415  heavy metal transport/detoxification protein  55.74 
 
 
64 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0117  Heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 
64 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295376 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1654  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.529157  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1993  hypothetical protein  42.86 
 
 
65 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3559  heavy metal transport/detoxification protein  58.49 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  41.27 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0504  putative cheavy metal binding protein  42.37 
 
 
111 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3036  heavy metal-binding domain-containing protein  42.37 
 
 
111 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2056  heavy metal-binding domain-containing protein  42.37 
 
 
111 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0309  heavy metal-binding domain-containing protein  42.37 
 
 
111 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0322  heavy metal-binding domain-containing protein  42.37 
 
 
111 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2228  heavy metal-binding domain-containing protein  42.37 
 
 
111 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0282  heavy metal-binding domain-containing protein  40.68 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0643  hypothetical protein  46.77 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0113  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612125  normal  0.480924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  33.33 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  37.29 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2989  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2375  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2899  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  38.18 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  32.2 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 
70 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
66 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  37.5 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0485  Heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 
73 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.477053 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1425  hypothetical protein  36.54 
 
 
65 aa  40.8  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0532  hypothetical protein  32.79 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000382467  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  33.9 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0448  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
73 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.268812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
64 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0415  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
73 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.341937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>