43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0117 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0117  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
64 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0225  heavy metal transport/detoxification protein  60.32 
 
 
67 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4881  heavy metal transport/detoxification protein  60.32 
 
 
64 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1654  Heavy metal transport/detoxification protein  53.97 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.529157  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2906  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3072  Heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.356914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3214  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1993  hypothetical protein  47.62 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4415  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
64 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 
67 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3559  heavy metal transport/detoxification protein  47.17 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  37.29 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0113  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
70 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612125  normal  0.480924 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
73 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  27.12 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2245  heavy metal transport/detoxification protein  27.12 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0282  heavy metal-binding domain-containing protein  42.37 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  28.81 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  28.81 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1862  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.384233  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  32.2 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  34.48 
 
 
64 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  32.2 
 
 
66 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  26.23 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  31.75 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
942 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3036  heavy metal-binding domain-containing protein  37.29 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2056  heavy metal-binding domain-containing protein  37.29 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0309  heavy metal-binding domain-containing protein  37.29 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0322  heavy metal-binding domain-containing protein  37.29 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0504  putative cheavy metal binding protein  37.29 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  30.51 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2228  heavy metal-binding domain-containing protein  37.29 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  30.51 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  32.2 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  30.51 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  38.33 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  35.94 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  28.57 
 
 
65 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>