42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1654 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1654  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
65 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.529157  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0117  Heavy metal transport/detoxification protein  53.97 
 
 
64 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295376 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1993  hypothetical protein  46.88 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4881  heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
64 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3072  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.356914 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
79 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4415  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
64 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  42.86 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2906  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
65 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3214  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
65 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 
64 aa  52  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  36.07 
 
 
81 aa  51.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
69 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3559  heavy metal transport/detoxification protein  49.06 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  44.26 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  32.2 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0225  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2245  heavy metal transport/detoxification protein  30.51 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  44.23 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
62 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4089  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0282  heavy metal-binding domain-containing protein  46.67 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
65 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  40 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  40 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3404  hypothetical protein  31.15 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  35 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  31.15 
 
 
66 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  31.15 
 
 
66 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  34.85 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2989  Heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  34.85 
 
 
68 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>