146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0819 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  97.22 
 
 		 360 aa  694    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 360 aa  710    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  96.94 
 
 		 360 aa  691    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  76.94 
 
 		 360 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  71.51 
 
 		 359 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  71.51 
 
 		 359 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  38.44 
 
 		 353 aa  249  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  38.65 
 
 		 357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  33.89 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  36.26 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  33.06 
 
 		 331 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  34.46 
 
 		 292 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.22 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  33.15 
 
 		 307 aa  175  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  33.05 
 
 		 297 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  33.24 
 
 		 289 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  34.96 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  27.59 
 
 		 458 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  28.38 
 
 		 458 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  26.21 
 
 		 456 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  27.37 
 
 		 455 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  37.79 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  29.69 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  25.77 
 
 		 456 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  34.77 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  34.44 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  31.81 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  31.32 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  28.29 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  33.43 
 
 		 313 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  31.03 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  29.02 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  39.02 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  38.61 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  38.43 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  43.5 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  38.76 
 
 		 398 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  41.8 
 
 		 367 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  32.05 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  31.54 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  32.69 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  37.32 
 
 		 390 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  37.8 
 
 		 390 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  30.49 
 
 		 312 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  29.11 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.11 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  28.8 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  35.96 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  29.7 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  29.59 
 
 		 433 aa  113  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  28.01 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  28.13 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  30.43 
 
 		 579 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  28.77 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  25.55 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  28.62 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  31.86 
 
 		 316 aa  102  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  25.99 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  25.38 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.38 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  28.2 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  25.21 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.91 
 
 		 296 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  25.34 
 
 		 315 aa  94  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0661  hypothetical protein  32.62 
 
 		 273 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  34.16 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  23.25 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.4 
 
 		 296 aa  89.7  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.46 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  31.19 
 
 		 319 aa  86.7  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.27 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  20.56 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  24.08 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  25.09 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  25.21 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  26.84 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  22.79 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  21.76 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  29.65 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  24.82 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0668  hypothetical protein  24.92 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  21.43 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  21.3 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  24.58 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  23.77 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  25.34 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  25 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  24.89 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  24.56 
 
 		 301 aa  57  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  26.35 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  24.78 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1496  Mammalian cell entry related domain protein  26.35 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024979  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1960  hypothetical protein  23.66 
 
 		 327 aa  54.3  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0139154  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  24.32 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  22.26 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  23.64 
 
 		 356 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  24.31 
 
 		 321 aa  53.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3826  virulence factor Mce family protein  25.5 
 
 		 341 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>