More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2427 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  100 
 
 		 287 aa  588  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  61.03 
 
 		 312 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  59.07 
 
 		 318 aa  343  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  56.45 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  51.93 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  52.31 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  52.31 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  53.73 
 
 		 312 aa  286  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  43.37 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  46.62 
 
 		 332 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  33.1 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  33.59 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 		 342 aa  125  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  32.09 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  34.22 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  33.65 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  28.92 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 		 319 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  29.56 
 
 		 438 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  32.89 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  31.62 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  31.62 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  34 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  34 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 		 339 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  32 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 		 364 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  35.35 
 
 		 264 aa  113  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  30.77 
 
 		 364 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  35.39 
 
 		 327 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  32.69 
 
 		 319 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  32.69 
 
 		 319 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  32.6 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  32.43 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  33.84 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  33.47 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  33.84 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  33.84 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  33.84 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  33.84 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  33.84 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  33.84 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  31.56 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 		 351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  32.94 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 337 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  29.86 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 		 313 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  29.72 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  32.03 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  34.33 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.06 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 		 321 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  30.29 
 
 		 644 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 		 310 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  29.08 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  30 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  32.48 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  30.43 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  28.75 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  32.06 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  31.66 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 		 312 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.31 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 		 346 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  27.82 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 		 317 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  29.79 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 		 321 aa  99.4  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  31.03 
 
 		 300 aa  99  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  32.47 
 
 		 309 aa  99  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  32.79 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  32.13 
 
 		 637 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  27.82 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  25.27 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  31.66 
 
 		 319 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 319 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 		 342 aa  95.5  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  25.43 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  31.67 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>