48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1354 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  100 
 
 		 222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  55.9 
 
 		 191 aa  221  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  53.81 
 
 		 194 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  48.98 
 
 		 193 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  47.96 
 
 		 207 aa  175  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  47.74 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 195 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  48.63 
 
 		 176 aa  155  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  39.8 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.08 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.68 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.76 
 
 		 190 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.08 
 
 		 194 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  34.54 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  33.16 
 
 		 437 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.96 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  34.36 
 
 		 194 aa  99.8  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  31.46 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.01 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  29.81 
 
 		 193 aa  72  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  27.75 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  25.68 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  25.61 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.5 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.33 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  28.12 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  28.89 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  28.85 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.73 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.53 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  22.99 
 
 		 181 aa  49.3  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  24.05 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7174  hypothetical protein  30.1 
 
 		 307 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.52 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  23.7 
 
 		 180 aa  45.8  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.11 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.47 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  22.37 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  25.17 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  22.58 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2331  hypothetical protein  26.21 
 
 		 353 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3098  hypothetical protein  26.21 
 
 		 353 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1349  hypothetical protein  26.21 
 
 		 353 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1064  hypothetical protein  26.21 
 
 		 353 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1437  hypothetical protein  26.21 
 
 		 353 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.68 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.66 
 
 		 183 aa  42  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  20.48 
 
 		 176 aa  41.6  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>