More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1917 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 85 aa  174  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  89.16 
 
 		 86 aa  156  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  92 
 
 		 88 aa  144  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2171  30S ribosomal protein S17  90.67 
 
 		 88 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.275223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  90.67 
 
 		 88 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  86.84 
 
 		 87 aa  141  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  73.75 
 
 		 82 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  70 
 
 		 80 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  71.25 
 
 		 81 aa  120  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 		 82 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  69.51 
 
 		 82 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  69.51 
 
 		 82 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  69.51 
 
 		 82 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 		 82 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  71.62 
 
 		 80 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 		 80 aa  107  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 		 80 aa  107  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 		 79 aa  105  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  64.1 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  71.83 
 
 		 80 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  64.1 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  71.83 
 
 		 80 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  71.83 
 
 		 80 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 		 79 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  64.1 
 
 		 78 aa  104  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 		 78 aa  103  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 		 79 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 		 76 aa  99.8  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 80 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 80 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 80 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  56.47 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0294  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 76 aa  94  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  62.5 
 
 		 86 aa  93.2  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  56.67 
 
 		 92 aa  92.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 82 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  58.02 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2809  30S ribosomal protein S17  62.5 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.718975  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  61.43 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 100 aa  89.4  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0600  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 		 76 aa  89.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  53.85 
 
 		 91 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  53.85 
 
 		 91 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1258  30S ribosomal protein S17  65.33 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406914  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  59.72 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1344  SSU ribosomal protein S17P  65.33 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  53.16 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  52.56 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  58.82 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  52.56 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  57.35 
 
 		 86 aa  84  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  52.56 
 
 		 88 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  52.56 
 
 		 88 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0414  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 87 aa  83.6  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000036421  normal  0.356143 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  52.86 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  53.42 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  52.78 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0403  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0378  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3900  30S ribosomal protein S17  54.29 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00230536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  52.78 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1349  30S ribosomal protein S17  53.42 
 
 		 190 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  52.78 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  50 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  57.35 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  52.11 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  57.97 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 82 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  54.41 
 
 		 98 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  55.88 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  52.78 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  57.58 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  54.41 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  53.85 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  57.58 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  54.17 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2765  30S ribosomal protein S17  53.42 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144726  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  53.52 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  52.94 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  56.52 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  49.37 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  51.39 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>