More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1539 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 312 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  85.81 
 
 		 330 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  56.23 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  54.63 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  54.95 
 
 		 331 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  56.96 
 
 		 315 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  51.16 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  47.87 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  48.21 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  44.88 
 
 		 303 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  45.6 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  41.69 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  41.08 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  39.38 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  40.85 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  38.98 
 
 		 276 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  38.75 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  38.34 
 
 		 255 aa  146  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  38.19 
 
 		 276 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  38.14 
 
 		 241 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  38.31 
 
 		 447 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  38.24 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  38.98 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  39.08 
 
 		 272 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  34.1 
 
 		 417 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  40.38 
 
 		 436 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  34.85 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  35.03 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  33.46 
 
 		 436 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  32.83 
 
 		 456 aa  108  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  27.74 
 
 		 561 aa  106  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  27.74 
 
 		 561 aa  106  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  31.32 
 
 		 436 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  30.05 
 
 		 577 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  30.05 
 
 		 577 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  24.01 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  26.59 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  44.86 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  21.37 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.39 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  37.76 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 244 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 250 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  31.62 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  37.14 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  34.76 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  38 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  37.06 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  40.21 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 232 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.76 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  34.56 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  33.14 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 258 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 241 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1783  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 300 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  34.15 
 
 		 235 aa  52.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 218 aa  52.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.21 
 
 		 256 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  34.85 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  39.18 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 2490 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003041  hypothetical protein  24.76 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  38.53 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1247  Methyltransferase type 12  36.23 
 
 		 196 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  35.19 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  36.73 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.11 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.85 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1601  hypothetical protein  40.95 
 
 		 209 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0256  methyltransferase type 11  40.95 
 
 		 209 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  35.51 
 
 		 259 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 226 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  32.7 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 210 aa  49.7  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  31.68 
 
 		 283 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 266 aa  49.7  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  31.68 
 
 		 252 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  31.68 
 
 		 242 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 239 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  31.68 
 
 		 242 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  31.68 
 
 		 242 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  33 
 
 		 232 aa  49.3  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>