More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1146 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  100 
 
 		 226 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  84.88 
 
 		 207 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  75.29 
 
 		 202 aa  254  9e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  77.02 
 
 		 202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  72.93 
 
 		 204 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  77.99 
 
 		 202 aa  251  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  68.12 
 
 		 228 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  65.66 
 
 		 210 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  64.6 
 
 		 204 aa  223  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  64.6 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  64.6 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  64.46 
 
 		 210 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  56.5 
 
 		 208 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.02 
 
 		 217 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  60.22 
 
 		 222 aa  218  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  62.28 
 
 		 187 aa  211  9e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  64.74 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  52.02 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  63.52 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  62.26 
 
 		 206 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  58.23 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  60.39 
 
 		 205 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  63.09 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  51.6 
 
 		 203 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  59.06 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  56.88 
 
 		 213 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  49.7 
 
 		 181 aa  155  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  44.51 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  45.74 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  45.93 
 
 		 189 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  46.51 
 
 		 186 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  45.51 
 
 		 186 aa  141  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  45.4 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  46.58 
 
 		 197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  42.6 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  50.7 
 
 		 181 aa  135  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  41.11 
 
 		 179 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  44.79 
 
 		 181 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  42.7 
 
 		 205 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  44.25 
 
 		 188 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  41.85 
 
 		 187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  44 
 
 		 187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1647  GrpE protein  41.75 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.165316  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  42.22 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  40.98 
 
 		 201 aa  126  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  41.33 
 
 		 240 aa  125  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  43.93 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  42.11 
 
 		 157 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  38.83 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  41.67 
 
 		 209 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  47.06 
 
 		 192 aa  121  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  41.96 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  39.63 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  37.7 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  38.76 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  39.51 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  42 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  37.81 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  39.02 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  36.32 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  41.61 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  37.8 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  40.52 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  43.6 
 
 		 180 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  44.08 
 
 		 189 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  38.56 
 
 		 212 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  39.24 
 
 		 203 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  40.14 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  35.42 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  40.14 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  36.61 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  38.41 
 
 		 206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  41.96 
 
 		 200 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  40.79 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  38.73 
 
 		 204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  38.61 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  39.25 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 		 205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  47.09 
 
 		 171 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  47.09 
 
 		 171 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  44.08 
 
 		 181 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  38.2 
 
 		 180 aa  112  6e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  41.33 
 
 		 185 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  46.05 
 
 		 181 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  41.33 
 
 		 185 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  43.75 
 
 		 198 aa  111  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  36.99 
 
 		 175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  40.51 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  44.08 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  42.31 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  43.14 
 
 		 181 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  40.31 
 
 		 186 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  41.84 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>