More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1904 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 409 aa  796    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  67.16 
 
 		 432 aa  556  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  67.25 
 
 		 433 aa  550  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  67.08 
 
 		 449 aa  549  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  66.58 
 
 		 435 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  66.58 
 
 		 440 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  66.58 
 
 		 440 aa  542  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  65.94 
 
 		 430 aa  543  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  66.58 
 
 		 424 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  66.33 
 
 		 443 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  67.16 
 
 		 444 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  66.91 
 
 		 444 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  67.16 
 
 		 444 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  66.67 
 
 		 444 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  60.6 
 
 		 410 aa  479  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  61.18 
 
 		 417 aa  477  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  47.22 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  46.78 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  47.67 
 
 		 413 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  47.29 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  47.04 
 
 		 419 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  47.29 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  47.64 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  46.79 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  47.04 
 
 		 419 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  50 
 
 		 449 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  45.71 
 
 		 445 aa  368  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  45.72 
 
 		 437 aa  359  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  45.28 
 
 		 442 aa  359  5e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  46.12 
 
 		 416 aa  358  7e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  44.74 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  44.74 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  46.19 
 
 		 441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  47.32 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  47.86 
 
 		 448 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  44.74 
 
 		 440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  46.17 
 
 		 434 aa  355  5.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  45.48 
 
 		 437 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  47.07 
 
 		 417 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  45.48 
 
 		 437 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  47.07 
 
 		 417 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  44.44 
 
 		 436 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  44.74 
 
 		 440 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  45.97 
 
 		 437 aa  352  5e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  44.44 
 
 		 436 aa  352  5e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  46.7 
 
 		 416 aa  352  7e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  47.17 
 
 		 426 aa  351  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  44.5 
 
 		 439 aa  351  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  47.85 
 
 		 402 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  45.01 
 
 		 434 aa  349  5e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  48.28 
 
 		 419 aa  349  6e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  45.26 
 
 		 434 aa  349  6e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  44.89 
 
 		 409 aa  348  7e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  47.89 
 
 		 416 aa  348  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  44.28 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  46.55 
 
 		 411 aa  346  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  46.59 
 
 		 411 aa  345  7e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  46.27 
 
 		 411 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  46.27 
 
 		 411 aa  344  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  46.34 
 
 		 411 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  46.27 
 
 		 411 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  46.27 
 
 		 411 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  43.84 
 
 		 437 aa  345  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  46.34 
 
 		 411 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  44.63 
 
 		 441 aa  343  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  45.5 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  44.22 
 
 		 413 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  46.34 
 
 		 411 aa  339  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  46.65 
 
 		 436 aa  339  5e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  45.85 
 
 		 411 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  44.63 
 
 		 438 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  42.93 
 
 		 409 aa  334  2e-90  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  43.94 
 
 		 411 aa  332  6e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  43.13 
 
 		 430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  42.45 
 
 		 445 aa  316  5e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  46.93 
 
 		 428 aa  315  8e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  44.05 
 
 		 440 aa  311  1e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  41.79 
 
 		 457 aa  306  6e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  42.13 
 
 		 457 aa  306  6e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  41.4 
 
 		 457 aa  305  9.000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  44.76 
 
 		 409 aa  301  1e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  42.68 
 
 		 423 aa  299  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  40.49 
 
 		 425 aa  298  9e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  43.3 
 
 		 432 aa  295  8e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  39.71 
 
 		 422 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  39.07 
 
 		 409 aa  292  8e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  39.1 
 
 		 416 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  39.1 
 
 		 416 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  39.31 
 
 		 420 aa  290  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  38.33 
 
 		 409 aa  289  6e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  38.67 
 
 		 416 aa  289  7e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  38.67 
 
 		 416 aa  289  7e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  38.85 
 
 		 412 aa  289  8e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  40.84 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  40.84 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  41.09 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  38.33 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  40.59 
 
 		 423 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  40.59 
 
 		 423 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  42.41 
 
 		 452 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>