More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1347 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 		 405 aa  837    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  0.000000000139909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  70.86 
 
 		 405 aa  615  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.2 
 
 		 408 aa  474  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.31 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  54.93 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.75 
 
 		 451 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.27 
 
 		 404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.23 
 
 		 412 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.37 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  50.25 
 
 		 412 aa  435  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.59 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  50.88 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.36 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.6 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.6 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.22 
 
 		 413 aa  430  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.61 
 
 		 421 aa  430  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.5 
 
 		 415 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.25 
 
 		 416 aa  425  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  49.75 
 
 		 414 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  50.38 
 
 		 412 aa  421  1e-117  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  49.63 
 
 		 420 aa  421  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  51.12 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.13 
 
 		 406 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.36 
 
 		 425 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  49.75 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  48.64 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.12 
 
 		 657 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.75 
 
 		 662 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  49.75 
 
 		 405 aa  417  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.72 
 
 		 409 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  49 
 
 		 413 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.14 
 
 		 408 aa  413  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.26 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.87 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  49.13 
 
 		 626 aa  411  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.75 
 
 		 404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.62 
 
 		 414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.5 
 
 		 419 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  47.01 
 
 		 425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.25 
 
 		 629 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.86 
 
 		 416 aa  401  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.64 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  48.64 
 
 		 414 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  48.64 
 
 		 414 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  48.76 
 
 		 422 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.88 
 
 		 678 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.87 
 
 		 621 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  47.65 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.4 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.62 
 
 		 774 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0854  aminotransferase, class V  46.52 
 
 		 403 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.87 
 
 		 630 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0767  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 403 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  49 
 
 		 679 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.51 
 
 		 403 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.65 
 
 		 413 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 		 641 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.75 
 
 		 605 aa  388  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.04 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.01 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.41 
 
 		 413 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.75 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  47.62 
 
 		 661 aa  388  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.55 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.89 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  46.65 
 
 		 403 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.04 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  46.98 
 
 		 410 aa  385  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.31 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.28 
 
 		 406 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  47.16 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.93 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  47.63 
 
 		 666 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  47.16 
 
 		 414 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  47.63 
 
 		 682 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  47.87 
 
 		 688 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.55 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  48.83 
 
 		 408 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  47.38 
 
 		 665 aa  383  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.8 
 
 		 406 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.78 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.12 
 
 		 673 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  47.04 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.04 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  48.03 
 
 		 413 aa  378  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.54 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  47.04 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.8 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  49.1 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.54 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.04 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.8 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.27 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.04 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.12 
 
 		 650 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.54 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.55 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.54 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>