205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0110 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0110  permease  100 
 
 		 321 aa  629  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  57.78 
 
 		 322 aa  345  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  50.96 
 
 		 315 aa  326  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  49.37 
 
 		 323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  50.79 
 
 		 318 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  50.64 
 
 		 315 aa  318  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  52.2 
 
 		 319 aa  317  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  47.32 
 
 		 323 aa  310  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  49.51 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  53.87 
 
 		 317 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  49.67 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  50.96 
 
 		 315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  50.49 
 
 		 363 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  50.97 
 
 		 352 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  51.27 
 
 		 315 aa  301  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  48.58 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  50.32 
 
 		 351 aa  298  7e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  48.62 
 
 		 331 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  48.62 
 
 		 331 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  49.67 
 
 		 348 aa  295  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  48.92 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  50.97 
 
 		 351 aa  293  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  47.1 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  48 
 
 		 331 aa  292  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  46.95 
 
 		 335 aa  292  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  48.31 
 
 		 331 aa  292  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  48 
 
 		 331 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  47.38 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  45.45 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  47 
 
 		 349 aa  289  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  48.06 
 
 		 364 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  47.13 
 
 		 356 aa  288  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  49.68 
 
 		 315 aa  288  7e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  44.04 
 
 		 332 aa  288  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  47.63 
 
 		 353 aa  288  8e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  50.8 
 
 		 324 aa  288  9e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  48.7 
 
 		 350 aa  285  5.999999999999999e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  46.41 
 
 		 352 aa  285  7e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  47.8 
 
 		 341 aa  285  8e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  49.03 
 
 		 348 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  45.26 
 
 		 332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  45.26 
 
 		 332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  46.56 
 
 		 350 aa  281  7.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  48.08 
 
 		 381 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  48.84 
 
 		 370 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  45.63 
 
 		 338 aa  278  8e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  47.95 
 
 		 349 aa  278  9e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  49.52 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  44.21 
 
 		 337 aa  277  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  47.91 
 
 		 366 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  48.52 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  46.65 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  49.19 
 
 		 362 aa  275  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  47.59 
 
 		 366 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  45.99 
 
 		 336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  46.45 
 
 		 345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  46.79 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  48.2 
 
 		 354 aa  272  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  44.34 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  46.88 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  42.19 
 
 		 319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  43.08 
 
 		 319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  43.21 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  48.37 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  41.46 
 
 		 334 aa  263  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  47.74 
 
 		 377 aa  262  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  48.58 
 
 		 318 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  48.9 
 
 		 318 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  44.37 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  43.03 
 
 		 328 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  48.04 
 
 		 350 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  47.32 
 
 		 318 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  45.2 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  40.88 
 
 		 331 aa  255  8e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  44.22 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  40.13 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  40.41 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  46.75 
 
 		 332 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  42.05 
 
 		 337 aa  248  9e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  45.14 
 
 		 371 aa  245  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  42.86 
 
 		 284 aa  242  7e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  48.17 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  41.97 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  39.81 
 
 		 338 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  41.25 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  39.94 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  33.11 
 
 		 316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  32.78 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  34.6 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  34.28 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  31.31 
 
 		 307 aa  158  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  31.76 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  30.43 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  31.38 
 
 		 294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  32.25 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  32.76 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  31.96 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  29.61 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  29.36 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  30.59 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>