More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1397 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  91.09 
 
 
539 aa  964    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  92.76 
 
 
539 aa  988    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  77.66 
 
 
546 aa  851    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
539 aa  1093    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.95 
 
 
552 aa  711    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  48.47 
 
 
540 aa  490  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  48.65 
 
 
543 aa  486  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.38 
 
 
542 aa  474  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  49.04 
 
 
562 aa  474  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  47.43 
 
 
542 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  45.57 
 
 
589 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  41.02 
 
 
576 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.38 
 
 
608 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5615  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.46 
 
 
579 aa  363  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.45 
 
 
638 aa  363  6e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  38.65 
 
 
568 aa  361  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  37.88 
 
 
591 aa  359  9e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  41.07 
 
 
609 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8670  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.76 
 
 
579 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  38.83 
 
 
598 aa  355  2e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  41.79 
 
 
582 aa  355  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  40.33 
 
 
584 aa  355  2e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5984  L-aspartate oxidase  37.3 
 
 
574 aa  352  7e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.937659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.22 
 
 
623 aa  352  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.39 
 
 
644 aa  350  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.81 
 
 
627 aa  350  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.52 
 
 
626 aa  350  4e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.16 
 
 
599 aa  348  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.78 
 
 
570 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  39.12 
 
 
606 aa  347  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  37.94 
 
 
646 aa  345  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.8 
 
 
646 aa  345  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.28 
 
 
646 aa  343  5e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.45 
 
 
648 aa  342  8e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.45 
 
 
648 aa  342  8e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.64 
 
 
644 aa  342  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.45 
 
 
648 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  38.07 
 
 
602 aa  340  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.97 
 
 
637 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  38.09 
 
 
576 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  37.69 
 
 
641 aa  333  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.58 
 
 
643 aa  333  5e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.04 
 
 
595 aa  332  7.000000000000001e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  37.41 
 
 
575 aa  332  8e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.55 
 
 
598 aa  332  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.4 
 
 
542 aa  331  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.81 
 
 
637 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.55 
 
 
578 aa  327  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.31 
 
 
579 aa  327  5e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  37.77 
 
 
594 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.11 
 
 
617 aa  325  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.91 
 
 
563 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.48 
 
 
568 aa  324  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0936  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.83 
 
 
612 aa  324  3e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.35 
 
 
575 aa  323  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.46 
 
 
575 aa  323  6e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.01 
 
 
605 aa  323  7e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1797  Succinate dehydrogenase  36.87 
 
 
598 aa  323  7e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.3 
 
 
605 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3926  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.12 
 
 
680 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.52 
 
 
605 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  35.52 
 
 
596 aa  319  7.999999999999999e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3969  L-aspartate oxidase  35.57 
 
 
585 aa  319  7.999999999999999e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.765371 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.58 
 
 
566 aa  319  1e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.75 
 
 
591 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.75 
 
 
591 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.75 
 
 
591 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.75 
 
 
591 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.3 
 
 
575 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.3 
 
 
575 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.75 
 
 
591 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.75 
 
 
591 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.75 
 
 
591 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.77 
 
 
600 aa  317  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.2 
 
 
587 aa  318  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3128  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.19 
 
 
610 aa  318  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  38.41 
 
 
633 aa  318  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  38.93 
 
 
585 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.08 
 
 
566 aa  317  3e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4625  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.1 
 
 
602 aa  316  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0290793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4398  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.5 
 
 
602 aa  316  6e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.05 
 
 
592 aa  316  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.93 
 
 
584 aa  316  7e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3147  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.49 
 
 
587 aa  316  8e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1202  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.13 
 
 
599 aa  316  8e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000072111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.57 
 
 
591 aa  315  9e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3884  L-aspartate oxidase  35.49 
 
 
587 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.207594 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04026  fumarate reductase  37.3 
 
 
602 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3836  fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.3 
 
 
602 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03988  hypothetical protein  37.3 
 
 
602 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3856  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.3 
 
 
602 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198988 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4713  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.3 
 
 
602 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5672  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.3 
 
 
602 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.140483 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2832  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.45 
 
 
609 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0155951  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.48 
 
 
621 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.44 
 
 
598 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4686  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.3 
 
 
602 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322244  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1129  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.17 
 
 
599 aa  314  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.91 
 
 
598 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.99 
 
 
592 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>