More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1274 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  100 
 
 		 436 aa  884    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  58.91 
 
 		 453 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  58.59 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  59.61 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  58.43 
 
 		 423 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  58.17 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  58.61 
 
 		 445 aa  473  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  58.37 
 
 		 445 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  59.14 
 
 		 428 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  55.24 
 
 		 431 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  54.63 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  57.82 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  57.59 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  56.17 
 
 		 449 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  56.17 
 
 		 417 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  55.5 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  54.96 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  55.1 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  52.4 
 
 		 417 aa  428  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  53.41 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1429  DNA polymerase IV  53.4 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.587123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  53.63 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  52.9 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  53.55 
 
 		 429 aa  418  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0385  DNA polymerase IV  58.4 
 
 		 417 aa  418  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.434794  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  54.46 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4721  DNA polymerase IV  54.55 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5188  DNA polymerase IV  53.59 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5260  DNA polymerase IV  54.84 
 
 		 415 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  54.09 
 
 		 435 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2844  DNA polymerase IV  50.25 
 
 		 411 aa  364  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.900402  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  47.06 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  37.47 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  41.34 
 
 		 426 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  37.47 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  37.28 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  38.62 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  42.11 
 
 		 363 aa  253  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  41.07 
 
 		 410 aa  253  6e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  42.29 
 
 		 410 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  40.72 
 
 		 430 aa  249  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.58 
 
 		 415 aa  249  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  39.29 
 
 		 430 aa  249  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  38.95 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  37.14 
 
 		 385 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  37.78 
 
 		 425 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  42.14 
 
 		 378 aa  245  9e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  40.58 
 
 		 420 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  37.04 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  39.33 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  43.14 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  40.29 
 
 		 419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  39.26 
 
 		 424 aa  242  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  40.36 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 481 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  42.31 
 
 		 374 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  39.37 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  40.06 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  40.06 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  39.55 
 
 		 367 aa  237  3e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  37.75 
 
 		 372 aa  236  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  40.17 
 
 		 466 aa  236  8e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  38.55 
 
 		 371 aa  235  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  43.2 
 
 		 355 aa  235  9e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  39.76 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  38.62 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  40.1 
 
 		 409 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  39.82 
 
 		 385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  40.24 
 
 		 363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  37.72 
 
 		 359 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  39.02 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  40.71 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  40.83 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  40.71 
 
 		 418 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  39.47 
 
 		 356 aa  229  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  38.84 
 
 		 364 aa  229  8e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  38.62 
 
 		 386 aa  229  8e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  40.71 
 
 		 378 aa  229  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  39.95 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  38.24 
 
 		 360 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  36.8 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  39.35 
 
 		 365 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  42.57 
 
 		 348 aa  226  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  40.24 
 
 		 359 aa  226  7e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  38.76 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  38.73 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  40.71 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  34.65 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  35.53 
 
 		 397 aa  224  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  38.58 
 
 		 359 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  35.24 
 
 		 345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  37.67 
 
 		 417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  34.12 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  34.47 
 
 		 409 aa  223  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  37.21 
 
 		 395 aa  223  7e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  37.9 
 
 		 371 aa  223  7e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  40.7 
 
 		 360 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  47.04 
 
 		 369 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  37.32 
 
 		 834 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  34.38 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>