More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3884 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  100 
 
 
267 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  57.74 
 
 
264 aa  262  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  51.39 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  48.95 
 
 
262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
262 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  45.24 
 
 
261 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  52.19 
 
 
257 aa  226  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  44.9 
 
 
253 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  47.28 
 
 
280 aa  221  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 
295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 
263 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  48.52 
 
 
265 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  48.52 
 
 
265 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  48.52 
 
 
263 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 
265 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  48.52 
 
 
265 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.96 
 
 
253 aa  218  6e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  42.91 
 
 
264 aa  217  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  48.54 
 
 
257 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  42.97 
 
 
253 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  53.2 
 
 
274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  43.6 
 
 
260 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  46.88 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  48.93 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  48.93 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  48.93 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  41.13 
 
 
279 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  42.44 
 
 
311 aa  209  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  41.2 
 
 
293 aa  209  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  41.2 
 
 
326 aa  208  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  48.1 
 
 
265 aa  208  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  43.46 
 
 
283 aa  208  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 
251 aa  208  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  46.5 
 
 
254 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  40 
 
 
308 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  47.7 
 
 
258 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  39.84 
 
 
259 aa  207  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  47.66 
 
 
254 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  41.2 
 
 
321 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  48.28 
 
 
266 aa  206  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  41.2 
 
 
321 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  40.71 
 
 
297 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  40.71 
 
 
297 aa  204  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  40.71 
 
 
297 aa  204  9e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  45.2 
 
 
324 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  43.88 
 
 
262 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  45.96 
 
 
254 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  40.32 
 
 
297 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  38.43 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.04 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0560  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  49.16 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  52.61 
 
 
273 aa  200  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  49.38 
 
 
339 aa  199  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  38.68 
 
 
266 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.4 
 
 
285 aa  198  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  39.36 
 
 
409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  48.75 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  44.09 
 
 
275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  39.61 
 
 
268 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  38.49 
 
 
307 aa  195  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  46.25 
 
 
286 aa  195  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
256 aa  195  8.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.64 
 
 
259 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  43.22 
 
 
259 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 
264 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  43.75 
 
 
536 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  36.11 
 
 
266 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  36.11 
 
 
266 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.73 
 
 
285 aa  192  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  43.04 
 
 
261 aa  191  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.97 
 
 
257 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  38.52 
 
 
418 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  45.16 
 
 
263 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.81 
 
 
257 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  42.98 
 
 
418 aa  190  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.2 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.23 
 
 
251 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0965  ABC transporter related  41.54 
 
 
293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  44.8 
 
 
424 aa  189  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  42.45 
 
 
253 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  44.36 
 
 
414 aa  188  9e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  48.61 
 
 
315 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  41.29 
 
 
266 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  46.38 
 
 
254 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  43.03 
 
 
261 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  42.57 
 
 
268 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  41.83 
 
 
303 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  44.71 
 
 
419 aa  186  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  46.38 
 
 
257 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  41.54 
 
 
274 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.98 
 
 
405 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1653  ABC transporter related protein  47.19 
 
 
254 aa  186  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  44.19 
 
 
264 aa  185  8e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  47.11 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  41.5 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3725  ABC transporter related protein  44.62 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  43.04 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  40.62 
 
 
490 aa  183  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  45.9 
 
 
259 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  45.49 
 
 
262 aa  182  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>